RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PLK1P53350 603 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ACAP1Q15027 740 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 OSMRQ99650 979 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL31Q9H511 634 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MCM8Q9UJA3 840 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SNPHO15079 494 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS14O43566 566 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT73Q86Y46 540 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf50Q9BV19 199 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ANAPC2Q9UJX6 822 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNK1O00180 336 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA6P08133 673 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVK-10P10266 1014 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL12AP19105 171 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 GRK4P32298 578 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP12AP54707 1039 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF280DQ6N043 979 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MTSS1LQ765P7 747 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF438Q7Z4V0 828 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CROCCP3Q8IVE0 287 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB106AQ8N104 65 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE9AO76083 593 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 UCMAQ8WVF2 138 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 HGH1Q9BTY7 390 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MROH8Q9H579 483 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 HMG20AQ9NP66 347 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 C2CD2Q9Y426 696 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB10A6NFE3 127 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KDELR1P24390 212 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 UBAP1Q9NZ09 502 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 INVSQ9Y283 1065 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 DYRK3O43781 588 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0U1RQJ8 604 aa24.58■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 F8VP50 259 aa24.58■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CHADO15335 359 aa24.58■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 OR1E1P30953 314 aa24.58■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA1P56199 1179 aa24.58■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa24.58■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN19P0C672 248 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 NOS3P29474 1203 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 FMO4P31512 558 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A3Q00325 362 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC7Q9H6L4 198 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAM32Q8TC27 787 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 DPEP1P16444 411 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.529e-6■■■□□ 18.1
GNPTAB-201ENST00000299314 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 IL27RAQ6UWB1 636 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 LZTR1Q8N653 840 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.57■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTT1P30711 240 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH8P55286 799 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 DNERQ8NFT8 737 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 YWHAQP27348 245 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGADQ13349 1161 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 LY6KQ17RY6 165 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 LACTBL1A8MY62 500 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2A2P52657 109 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PARP6Q2NL67 630 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MARK4Q96L34 752 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNH1O95259 989 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PAICSP22234 425 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR59Q6PJI9 974 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CAMK1DQ8IU85 385 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTL7BQ9Y614 415 aa24.56■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP5P24588 427 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MACC1Q6ZN28 852 aa24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms