RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 TFAP2AP05549 437 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 THRAP10827 490 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SPRP35270 261 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 GLUD2P49448 558 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SLC26A2P50443 739 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 LIMK2P53671 638 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 DLG2Q15700 870 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CLEC14AQ86T13 490 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 FAM131BQ86XD5 332 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SNX32Q86XE0 403 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 C7orf31Q8N865 590 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MOCOSQ96EN8 888 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 AGAP2Q99490 1192 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 FZD10Q9ULW2 581 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PDLIM1O00151 329 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 VILLO15195 856 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TRIM13O60858 407 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PGK2P07205 417 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 POU5F1BQ06416 359 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 DSELQ8IZU8 1212 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 OR52K1Q8NGK4 314 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SPON1Q9HCB6 807 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.25■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RGSL1A5PLK6 1076 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CRTAMO95727 393 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CHRNGP07510 517 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MPSTP25325 297 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ABCG1P45844 678 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 THOP1P52888 689 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CNGA3Q16281 694 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 KYAT1Q16773 422 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 C16orf89Q6UX73 402 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 STRADAQ7RTN6 431 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 KYQ8NBH2 561 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MPP4Q96JB8 637 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CNDP1Q96KN2 507 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SERPINI1Q99574 410 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ACSS2Q9NR19 701 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RAB26Q9ULW5 256 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CITO14578 2027 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 KPNA7A9QM74 516 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 NEMP1O14524 444 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 VTNP04004 478 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ADORA2BP29275 332 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RGS2P41220 211 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ADGRE1Q14246 886 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PIGGQ5H8A4 983 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CCNYQ8ND76 341 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 AGAP3Q96P47 875 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CDRT15Q96T59 188 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PRDM12Q9H4Q4 367 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 LZTS1Q9Y250 596 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.24■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MATN2O00339 956 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 USP12O75317 370 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CLPTM1O96005 669 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ASLP04424 464 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MPOP05164 745 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 C2P06681 752 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 INSRRP14616 1297 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MAP7Q14244 749 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 FLOT2Q14254 428 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms