RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 MTSS1LQ765P7 747 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CREG2Q8IUH2 290 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 DCLK3Q9C098 648 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 DTLQ9NZJ0 730 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
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TTPA-201ENST00000260116 CBX4O00257 560 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 MT-CO1P00395 513 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PFKLP17858 780 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 LMAN2Q12907 356 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 EMC10Q5UCC4 262 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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TTPA-201ENST00000260116 FAM217AQ8IXS0 508 aa11.14□□□□□ -0.63
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TTPA-201ENST00000260116 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ATP2A3Q93084 1043 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 NXPE3Q969Y0 559 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 HMCESQ96FZ2 354 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ZNF670Q9BS34 389 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.14□□□□□ -0.63
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TTPA-201ENST00000260116 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D14Q9P2M4 693 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 A0A1B0GVM2 712 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TCAF2A6NFQ2 919 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 WASH3PC4AMC7 463 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PRRT4C9JH25 899 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 H3BRJ5 948 aa11.14□□□□□ -0.63
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TTPA-201ENST00000260116 K7ERQ8 282 aa11.14□□□□□ -0.63
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TTPA-201ENST00000260116 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PDK2Q15119 407 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SEL1L2Q5TEA6 688 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CCNYQ8ND76 341 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ACTL9Q8TC94 416 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 MTG2Q9H4K7 406 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PIAS3Q9Y6X2 628 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 DRGXA6NNA5 263 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 APOL1O14791 398 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CHADO15335 359 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 BNIP3LO60238 219 aa11.13□□□□□ -0.63
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TTPA-201ENST00000260116 AIF1P55008 147 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SEC13P55735 322 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 FUT11Q495W5 492 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 MPPE1Q53F39 396 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 IL31Q6EBC2 164 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 EXOC2Q96KP1 924 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CIPCQ9C0C6 399 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 VPS28Q9UK41 221 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TECTAO75443 2155 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 VAV1P15498 845 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ETFBP38117 255 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 OPRD1P41143 372 aa11.13□□□□□ -0.63
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TTPA-201ENST00000260116 GDF10P55107 478 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TDGQ13569 410 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PON2Q15165 354 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CACUL1Q86Y37 369 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CPXM2Q8N436 756 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 KIF18AQ8NI77 898 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 FAM71BQ8TC56 605 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 USP33Q8TEY7 942 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 FAF2Q96CS3 445 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.13□□□□□ -0.63
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