RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228827.7

GPN3-201, Transcript of GPN-loop GTPase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPN3, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3-201ENST00000228827 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.65□□□□□ -0.06
GPN3-201ENST00000228827 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.65□□□□□ -0.06
GPN3-201ENST00000228827 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GPN3-201ENST00000228827 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GPN3-201ENST00000228827 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.65□□□□□ -0.06
GPN3-201ENST00000228827 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GPN3-201ENST00000228827 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.65□□□□□ -0.06
GPN3-201ENST00000228827 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.65□□□□□ -0.06
GPN3-201ENST00000228827 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.65□□□□□ -0.06
GPN3-201ENST00000228827 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 MID1O15344 667 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 GJB6O95452 261 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 SEMA4FO95754 770 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 F9P00740 461 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 VAV1P15498 845 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 NNMTP40261 264 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 PSMD8P48556 350 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ATP11AP98196 1134 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ZBTB16Q05516 673 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 FAM131BQ86XD5 332 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 STK40Q8N2I9 435 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 DEFB124Q8NES8 71 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 MUC3BQ9H195 1237 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 VPS28Q9UK41 221 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 LAMA1P25391 3075 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 A0A1B0GTW7 788 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 OPHN1O60890 802 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 CLDN11O75508 207 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 FSBPO95073 299 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 SYPP08247 313 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 MMP8P22894 467 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 CDH4P55283 916 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 OXCT1P55809 520 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 SULT2A1Q06520 285 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 CST6Q15828 149 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 CDO1Q16878 200 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 RAB6CQ53S08 254 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ALFQ53S48 1182 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 PTPRN2Q92932 1015 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ALG14Q96F25 216 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 FAM129BQ96TA1 746 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 MPP6Q9NZW5 540 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 A0A1W2PP55 124 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 TEX33O43247 280 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 SRGAP2O75044 1071 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 PLK1P53350 603 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 GRIK2Q13002 908 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ARID5BQ14865 1188 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 C5orf22Q49AR2 442 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ACCSLQ4AC99 568 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 LRRC31Q6UY01 552 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 SGK2Q9HBY8 427 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.63□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 E9PAM4 449 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 BNIP3LO60238 219 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 IL1BP01584 269 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 RHOCP08134 193 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 C7P10643 843 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 SLC8A1P32418 973 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 OMDQ99983 421 aa14.62□□□□□ -0.07
GPN3-201ENST00000228827 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms