RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000093061.6

Trim11-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim11, Length 2,251 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11-201ENSMUST00000093061 DazlQ64368 298 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 RbfaQ6P3B9 350 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gprc5aQ8BHL4 356 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fzd10Q8BKG4 582 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 ClmpQ8R373 373 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mgat5Q8R4G6 740 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nme3Q9WV85 169 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Speer3W4VSP1 261 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Col5a3Q9JLI2 1739 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Znf106O88466 1888 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Supt3B0QZW4 406 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm21293E9Q4G9 266 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm3739L7N296 216 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 PenkP22005 268 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Crabp2P22935 138 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Glud1P26443 558 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 DesP31001 469 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 S100bP50114 92 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Hrh2P97292 397 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Yy1Q00899 414 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc127Q3TC33 260 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Krt26Q3TRJ4 462 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Bnip1Q6QD59 228 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Xylt1Q811B1 953 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fam78aQ8C552 283 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slfn5Q8CBA2 884 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lrrc66Q8K0B3 872 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pofut2Q8VHI3 429 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rev1Q920Q2 1249 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Actrt1Q9D9J3 376 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tlr6Q9EPW9 795 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vmn2r25W4VSP2 855 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 PtprfA2A8L5 1898 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zfr2E9Q5M4 874 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm4788E9Q8B5 879 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ift81O35594 676 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gpr65Q61038 337 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mef2dQ63943 514 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Wee2Q66JT0 555 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 ItpkcQ7TS72 678 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Trim62Q80V85 475 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Atg16l1Q8C0J2 607 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Spdye4bQ8CDE8 236 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 H2-Q4Q8HWB2 354 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Taf7lQ9D3R9 471 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pex11bQ9Z210 259 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc8D3YZV8 685 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ism2D3Z6A3 493 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm8113E0CXS8 587 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Trim30bE9PVL6 203 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cldn5O54942 218 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Acot8P58137 320 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 S100a5P63084 93 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Smad1P70340 465 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Otol1Q4ZJM7 482 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tmtc3Q8BRH0 920 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Robo4Q8C310 1012 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Prr33Q8C494 260 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kcnc4Q8R1C0 628 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fuca2Q99KR8 461 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ddit4Q9D3F7 229 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dlgap1Q9D415 992 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tsga13Q9DA17 273 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Leng1Q9DB98 261 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kat2aQ9JHD2 830 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Syt5Q9R0N5 386 aa15.91■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rtl9Q32KG4 1339 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tcp11x2A2AEI7 503 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1023A2ASU6 311 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm5689F6Y2A6 97 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm20509G3UZF1 325 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Wnt3aP27467 352 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vps4bP46467 444 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dact3Q0PHV7 610 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Hsdl2Q2TPA8 490 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 OtulinQ3UCV8 352 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Map3k7Q62073 579 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gdpd5Q640M6 607 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tatdn1Q6P8M1 295 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zfp512bQ6PHP4 879 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dnajc6Q80TZ3 938 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Atg14Q8CDJ3 492 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dedd2Q8QZV0 330 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Agap3Q8VHH5 910 aa15.9■□□□□ 0.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sh2d4bA6X942 431 aa15.89■□□□□ 0.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 2610008E11RikG3X964 669 aa15.89■□□□□ 0.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr743L7N1Y2 311 aa15.89■□□□□ 0.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Serpini1O35684 410 aa15.89■□□□□ 0.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Hsd17b7O88736 334 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.5 ms