RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsd17b2P51658 381 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc40Q8BI79 1192 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam162aQ9D6U8 155 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FanceB8JJD6 213 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5152L7N200 190 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FlgP11088 336 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gabrr2P56476 465 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EsrrgP62509 458 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plcl1Q3USB7 1096 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpinb6Q60854 378 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbmx2Q8R0F5 326 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trmt10bQ9D075 318 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HaghlQ9DB32 283 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Duox1A2AQ92 1551 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp457L7N1X4 647 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tarbp2P97473 365 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cul4aQ3TCH7 759 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp3a11Q64459 504 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aoc2Q812C9 757 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 WwoxQ91WL8 414 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anks3Q9CZK6 655 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata9Q9D9R3 252 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5415E9PXF3 478 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HdcP23738 662 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lmo2P25801 158 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tap2P36371 702 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Morf4l1P60762 362 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IgfalsP70389 603 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dab2P98078 766 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfaip2Q61333 691 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lysmd3Q99LE3 305 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtif3Q9CZD5 276 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phf2Q9WTU0 1096 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4450E9Q007 373 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Top6blJ3QMY9 579 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klf6O08584 283 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpf3P58269 378 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xlr3aQ60595 226 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsd3b4Q61767 373 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ChfrQ810L3 664 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tigd4Q8BUZ3 513 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhb18Q91Y02 792 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc77Q9CZH8 489 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Terb2Q9D494 218 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr706Q9EPF8 316 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Egfl7Q9QXT5 275 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msl3Q9WVG9 525 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa13.07□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4985A2ALC6 410 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r74E9PW21 853 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KlO35082 1014 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt1P04104 637 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Impdh2P24547 514 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RxraP28700 467 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BtkP35991 659 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sar1aP36536 198 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NcstnP57716 708 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt2Q3TTY5 707 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grik5Q61626 979 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wee2Q66JT0 555 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim36Q80WG7 729 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ldlrap1Q8C142 308 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PreplQ8C167 725 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb9Q8CDC7 459 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Impg1Q8R1W8 798 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Art3Q8R2G4 371 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptpn3A2ALK8 913 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rrn3B2RS91 656 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bnc1O35914 961 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PhexP70669 749 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh6P97326 790 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpina3mQ03734 418 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Brms1lQ3U1T3 323 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CamkvQ3UHL1 512 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpd52Q62393 224 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hist2h2acQ64523 129 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hist2h2aa1Q6GSS7 130 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Poc5Q9DBS8 558 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nmnat1Q9EPA7 285 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbk1Q9WUN2 729 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RerglB2RVE2 204 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C87414E9PWI7 475 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr2lP62876 67 aa13.06□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plpp4Q0VBU9 271 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 97 ms