RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spred2Q924S7 410 aa12.96□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp6Q9DBB1 381 aa12.96□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plscr2Q9DCW2 307 aa12.96□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab13Q9DD03 202 aa12.96□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Copg2Q9QXK3 871 aa12.96□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tk2Q9R088 270 aa12.96□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ca8P28651 291 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map3k7Q62073 579 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syn2Q64332 586 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp16Q6PCP3 660 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cand2Q6ZQ73 1235 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec24bQ80ZX0 1251 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KyQ8C8H8 661 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clip4Q8CI96 704 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp5hQ9DCX2 161 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vwa7Q9JHA8 891 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 St6galnac4Q9R2B6 360 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ror1Q9Z139 937 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scn5aQ9JJV9 2019 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akap1O08715 857 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptger1P35375 405 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TankP70347 448 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SiaeP70665 541 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thumpd3P97770 505 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930430A15RikQ05AC5 485 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hhla1Q3TYV2 514 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pld5Q3UNN8 536 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psg28Q4KL66 472 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc5a10Q5SWY8 596 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d12Q6A039 696 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpc2Q8BKV1 579 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alg9Q8VDI9 611 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tceal1Q921P9 165 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim66Q924W6 1242 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GmprQ9DCZ1 345 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Strn3Q9ERG2 796 aa12.95□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kpna7C0LLJ0 499 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C87414E9PWI7 475 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grip2G3XA20 1042 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TpteG5E8H5 664 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r39L7N2E5 861 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChkaO54804 453 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmp1O55188 503 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hrh2P97292 397 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hipk4Q3V016 616 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fcrl5Q68SN8 596 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ahcyl1Q80SW1 530 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf473Q8BI67 892 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fcho1Q8K285 873 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudcd3Q8R1N4 363 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtbsQ8R242 366 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TgdsQ8VDR7 355 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr615Q8VGY4 313 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smim14Q91VT8 99 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pex6Q99LC9 981 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atad1Q9D5T0 361 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acox2Q9QXD1 681 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3iD3Z450 408 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atf6F6VAN0 656 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zc3h12bG3X9I7 835 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Icam1P13597 537 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lzts1P60853 599 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msx2Q03358 267 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tekt4Q149S1 447 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prmt9Q3U3W5 846 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc20a1Q61609 681 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp512bQ6PHP4 879 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ItpkcQ7TS72 678 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exoc3l1Q8BI71 739 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc17a6Q8BLE7 582 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc68Q8BVC4 333 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgat5Q8R4G6 740 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddit4Q9D3F7 229 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rin2Q9D684 903 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mpp5Q9JLB2 675 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dock1Q8BUR4 1865 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atg2aQ6P4T0 1914 aa12.94□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mageb4A2A9R3 556 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20721E9Q2U8 318 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spin2fJ3QPU0 254 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpini1O35684 410 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hes2O54792 157 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ShdO88834 343 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GsrP47791 500 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34 ms