RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641928.1

MFSD8-255, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 4,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-255	ENST00000641928	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	GJA5	P36382	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	RFC5	P40937	340 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	MIA2	Q96PC5	1412 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	ZMYM3	Q14202	1370 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	NES	P48681	1621 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	HFM1	A2PYH4	1435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	CLCN1	P35523	988 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	DDX12P	Q92771	950 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	RALBP1	Q15311	655 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	NFKBIB	Q15653	356 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	TICAM2	Q86XR7	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	TAF3	Q5VWG9	929 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	NGEF	Q8N5V2	710 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	KCNH8	Q96L42	1107 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	SPTLC1	O15269	473 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	HLA-C	Q95604	372 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	OCEL1	Q9H607	264 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	CCDC7	Q96M83	1385 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	NCOA1	Q15788	1441 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	ANKRD62	A6NC57	917 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-255	ENST00000641928	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	SLC10A3	P09131	477 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	MRE11	P49959	708 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	ADAMTS12	P58397	1594 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	JPH4	Q96JJ6	628 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	FLII	Q13045	1269 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	BANK1	Q8NDB2	785 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	TMC1	Q8TDI8	760 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	KIF15	Q9NS87	1388 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	5.01	□□□□□ -1.61	3e-9	■■■■□ 20.7
MFSD8-255	ENST00000641928	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	PEX14	O75381	377 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	GABBR2	O75899	941 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	FCHSD2	O94868	740 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	PADI6	Q6TGC4	694 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	HECW1	Q76N89	1606 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	FGD1	P98174	961 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	GLI2	P10070	1586 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-255	ENST00000641928	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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