RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636753.1

RYR3-222, Transcript of ryanodine receptor 3, human

TSL 5

Gene RYR3, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RYR3-222	ENST00000636753	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	SV2A	Q7L0J3	742 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	PTS	Q03393	145 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	NNT	Q13423	1086 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	PKD2	Q13563	968 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	FUT2	Q10981	343 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	UPP2	O95045	317 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	BMP2	P12643	396 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	MPND	Q8N594	471 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RYR3-222	ENST00000636753	CDC14C	A4D256	554 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	PAX4	O43316	350 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	BCR	P11274	1271 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	ITGA6	P23229	1130 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	SLC35F4	A4IF30	521 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	COL8A1	P27658	744 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753		Q3C1V9	767 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	MCTP1	Q6DN14	999 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	DOC2B	Q14184	412 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	TTLL8	A6PVC2	850 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	SH3BP2	P78314	561 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	CD163	Q86VB7	1156 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	GAS6	Q14393	721 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	MEIOB	Q8N635	442 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	ITPKC	Q96DU7	683 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RYR3-222	ENST00000636753	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	GCGR	P47871	477 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	RDH13	Q8NBN7	331 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	LRP8	Q14114	963 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	FAM161A	Q3B820	660 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	MBIP	Q9NS73	344 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	IGF1R	P08069	1367 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	SPTLC1	O15269	473 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	ACD	Q96AP0	544 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	OAT	P04181	439 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	PTGDR	Q13258	359 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	GRIN2C	Q14957	1233 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	OIP5	O43482	229 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	CHRNA4	P43681	627 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	NR5A1	Q13285	461 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	GATA4	P43694	442 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	CDK15	Q96Q40	435 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	PIK3R2	O00459	728 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	JUND	P17535	347 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RYR3-222	ENST00000636753	NR3C2	P08235	984 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	DYRK3	O43781	588 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	SULF1	Q8IWU6	871 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	BAP1	Q92560	729 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	SPINT1	O43278	529 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	ZNF511	Q8NB15	262 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	GMCL1	Q96IK5	515 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RYR3-222	ENST00000636753	RRAGC	Q9HB90	399 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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