RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-215	ENST00000628018	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.51	■■■□□ 2.95
CAPNS1-215	ENST00000628018	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
CAPNS1-215	ENST00000628018	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CAPNS1-215	ENST00000628018	NME9	Q86XW9	330 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CAPNS1-215	ENST00000628018	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
CAPNS1-215	ENST00000628018	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CAPNS1-215	ENST00000628018	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CAPNS1-215	ENST00000628018	ATF3	P18847	181 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CAPNS1-215	ENST00000628018	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CAPNS1-215	ENST00000628018	MSH6	P52701	1360 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	MST1R	Q04912	1400 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	MTHFS	P49914	203 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	COG3	Q96JB2	828 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	ORAI2	Q96SN7	254 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	33.39	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	KIF1A	Q12756	1690 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CAPNS1-215	ENST00000628018	INSR	P06213	1382 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CAPNS1-215	ENST00000628018	PIK3C2A	O00443	1686 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CAPNS1-215	ENST00000628018	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP31	Q70CQ4	1352 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CAPNS1-215	ENST00000628018	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	33.32	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	CFAP53	Q96M91	514 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	PSME1	Q06323	249 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	FOXO3	O43524	673 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	FBLN1	P23142	703 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
CAPNS1-215	ENST00000628018	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
CAPNS1-215	ENST00000628018	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CAPNS1-215	ENST00000628018	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CAPNS1-215	ENST00000628018	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CAPNS1-215	ENST00000628018	NLRP6	P59044	892 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CAPNS1-215	ENST00000628018	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CAPNS1-215	ENST00000628018	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CAPNS1-215	ENST00000628018	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CAPNS1-215	ENST00000628018	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
CAPNS1-215	ENST00000628018	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CAPNS1-215	ENST00000628018	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CAPNS1-215	ENST00000628018	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CAPNS1-215	ENST00000628018	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CAPNS1-215	ENST00000628018	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CAPNS1-215	ENST00000628018	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CAPNS1-215	ENST00000628018	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CAPNS1-215	ENST00000628018	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CAPNS1-215	ENST00000628018	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CAPNS1-215	ENST00000628018	PXDN	Q92626	1479 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-215	ENST00000628018	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-215	ENST00000628018	SBNO1	A3KN83	1393 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-215	ENST00000628018	SOX12	O15370	315 aa		33.07	■■■□□ 2.89
CAPNS1-215	ENST00000628018	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLIT3	O75094	1523 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	NFAT5	O94916	1531 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	IL13	P35225	146 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP19	O94966	1318 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CAPNS1-215	ENST00000628018	FLT4	P35916	1363 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	RUNDC1	Q96C34	613 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	APAF1	O14727	1248 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	LTN1	O94822	1766 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	AMPH	P49418	695 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	GC	P02774	474 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
CAPNS1-215	ENST00000628018	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.95	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	FCHSD2	O94868	740 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	HOXC9	P31274	260 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86

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