RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 PIK3C2AO00443 1686 aa28.67■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.67■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 TOM1O60784 492 aa28.67■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.67■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 PSME1Q06323 249 aa28.66■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 NME9Q86XW9 330 aa28.66■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.66■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.66■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 ALS2Q96Q42 1657 aa28.64■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.64■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.64■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.62■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.62■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 USP54Q70EL1 1684 aa28.61■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.61■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 SBNO1A3KN83 1393 aa28.6■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 PIP4K2BP78356 416 aa28.59■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 NSD2O96028 1365 aa28.59■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.59■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.59■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 USP31Q70CQ4 1352 aa28.58■■■□□ 2.17
CSAG3-202ENST00000617158 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CSAG3-202ENST00000617158 MIER1Q8N108 512 aa28.56■■■□□ 2.16
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.55■■■□□ 2.16
CSAG3-202ENST00000617158 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.54■■■□□ 2.16
CSAG3-202ENST00000617158 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CSAG3-202ENST00000617158 PHLPP1O60346 1717 aa28.53■■■□□ 2.16
CSAG3-202ENST00000617158 ANP32CO43423 234 aa28.53■■■□□ 2.16
CSAG3-202ENST00000617158 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.52■■■□□ 2.16
CSAG3-202ENST00000617158 ABTB2Q8N961 1025 aa28.51■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.51■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 RALBP1Q15311 655 aa28.5■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 MORC1Q86VD1 984 aa28.49■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 FBLN1P23142 703 aa28.48■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 NLRP6P59044 892 aa28.48■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 COG3Q96JB2 828 aa28.47■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 USP19O94966 1318 aa28.46■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 SLIT3O75094 1523 aa28.46■■■□□ 2.15
CSAG3-202ENST00000617158 PPP2R1AP30153 589 aa28.45■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.43■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 NFAT5O94916 1531 aa28.43■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGEF10O15013 1369 aa28.42■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC184Q52MB2 194 aa28.42■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 NLRP13Q86W25 1043 aa28.42■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 ABCA3Q99758 1704 aa28.41■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.39■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CSAG3-202ENST00000617158 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.38■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.37■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 PEAK1Q9H792 1746 aa28.37■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 POLKQ9UBT6 870 aa28.36■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 PLEKHG5O94827 1062 aa28.35■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 SOX12O15370 315 aa28.34■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 GCP02774 474 aa28.34■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 HSPA1LP34931 641 aa28.33■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.33■■■□□ 2.13
CSAG3-202ENST00000617158 MTHFSP49914 203 aa28.32■■■□□ 2.12
CSAG3-202ENST00000617158 SHPRHQ149N8 1683 aa28.32■■■□□ 2.12
CSAG3-202ENST00000617158 LTN1O94822 1766 aa28.32■■■□□ 2.12
CSAG3-202ENST00000617158 CCER2I3L3R5 266 aa28.31■■■□□ 2.12
CSAG3-202ENST00000617158 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.31■■■□□ 2.12
CSAG3-202ENST00000617158 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.29■■■□□ 2.12
CSAG3-202ENST00000617158 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CSAG3-202ENST00000617158 COL18A1P39060 1754 aa28.27■■■□□ 2.12
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.27■■■□□ 2.12
CSAG3-202ENST00000617158 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CSAG3-202ENST00000617158 INSRP06213 1382 aa28.24■■■□□ 2.11
CSAG3-202ENST00000617158 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CSAG3-202ENST00000617158 CPDO75976 1380 aa28.23■■■□□ 2.11
CSAG3-202ENST00000617158 JCADQ9P266 1359 aa28.23■■■□□ 2.11
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA0232Q92628 1395 aa28.21■■■□□ 2.11
CSAG3-202ENST00000617158 RGPD5Q99666 1765 aa28.2■■■□□ 2.11
CSAG3-202ENST00000617158 MRS2Q9HD23 443 aa28.2■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 HOXC9P31274 260 aa28.19■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 FBXO41Q8TF61 875 aa28.19■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.18■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 FLT4P35916 1363 aa28.18■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.18■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.18■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 RTL1A6NKG5 1358 aa28.17■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 IP6K1Q92551 441 aa28.17■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms