RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 TRDNQ13061 729 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 SLFN5Q08AF3 891 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 GCC1Q96CN9 775 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 STRN4Q9NRL3 753 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 GNAI2P04899 355 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 NUCB2P80303 420 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 MARCH6O60337 910 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 NFE2L2Q16236 605 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 CNTROBQ8N137 903 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 FANCAO15360 1455 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 WASHC4Q2M389 1173 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPRKQ15262 1439 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 FSD1Q9BTV5 496 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 BECN2A8MW95 431 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM29Q14134 588 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 NFKBIBQ15653 356 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.08■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 BACH2Q9BYV9 841 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF428Q96B54 188 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 NME9Q86XW9 330 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM177BA6PVY3 158 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS53Q5VIR6 699 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 BICD2Q8TD16 824 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 NEK4P51957 841 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP10BO94823 1461 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 NOS1P29475 1434 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 CABP4P57796 275 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 ARID3AQ99856 593 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 SPG7Q9UQ90 795 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-208ENST00000615445 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 DCTN1Q14203 1278 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM57Q8N5G2 664 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 RAD21O60216 631 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRCC1Q9C099 1032 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 PES1O00541 588 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 MCM10Q7L590 875 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 ERC1Q8IUD2 1116 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 FOSBP53539 338 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 ERICH2A1L162 156 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 MYL6BP14649 208 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.98■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.98■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.98■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.98■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMA5P28066 241 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 BTBD11A6QL63 1104 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 SIL1Q9H173 461 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 RABEP1Q15276 862 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXW7Q969H0 707 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC27Q2M243 656 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 SRGAP3O43295 1099 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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