RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 CNNM1Q9NRU3 951 aa13.2□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 CABP1Q9NZU7 370 aa13.2□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 ZNF592Q92610 1267 aa13.2□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.2□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 PPP2R1AP30153 589 aa13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 PSMA5P28066 241 aa13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 EFCAB5A4FU69 1503 aa13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 CDC45O75419 566 aa13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 TTC39AQ5SRH9 613 aa13.19□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 236
TNS1-221ENST00000615025 HECW1Q76N89 1606 aa13.18□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 ODF2Q5BJF6 829 aa13.18□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.18□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 SULT6B1Q6IMI4 303 aa13.18□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 WWC2Q6AWC2 1192 aa13.18□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 CCDC158Q5M9N0 1113 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 TOPBP1Q92547 1522 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 PRDM11Q9NQV5 511 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 ERBINQ96RT1 1412 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 SASS6Q6UVJ0 657 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 KDM4AO75164 1064 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 HIP1O00291 1037 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 EPS15P42566 896 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 GNAI2P04899 355 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 NUCB2P80303 420 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 SLC4A2P04920 1241 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-221ENST00000615025 MYL6BP14649 208 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 SYNJ1O43426 1573 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 38.5
TNS1-221ENST00000615025 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 ARAP1Q96P48 1450 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 CDR1P51861 262 aa13.12□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 OLFM4Q6UX06 510 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 HOMER1Q86YM7 354 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 MPHOSPH8Q99549 860 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 ATP2B2Q01814 1243 aa13.11□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 BTBD11A6QL63 1104 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 SIL1Q9H173 461 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 ZNF428Q96B54 188 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13.1□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 OFD1O75665 1012 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 GCC1Q96CN9 775 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 DAPK1P53355 1430 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 RUFY1Q96T51 708 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.09□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 NACAP1Q9BZK3 213 aa13.08□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
TNS1-221ENST00000615025 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.08□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 GSE1Q14687 1217 aa13.08□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.08□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.08□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 HMGXB3Q12766 1538 aa13.08□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 AK7Q96M32 723 aa13.08□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 ATP2B1P20020 1258 aa13.07□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 TOP2BQ02880 1626 aa13.07□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TNS1-221ENST00000615025 STK11IPQ8N1F8 1099 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms