RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598067.5

FCHO1-223, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-223	ENST00000598067	MYT1	Q01538	1121 aa		19.06	■□□□□ 0.64
FCHO1-223	ENST00000598067	VPS72	Q15906	364 aa		19.04	■□□□□ 0.64
FCHO1-223	ENST00000598067	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		19.04	■□□□□ 0.64
FCHO1-223	ENST00000598067	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
FCHO1-223	ENST00000598067	BTG4	Q9NY30	223 aa		19.03	■□□□□ 0.64
FCHO1-223	ENST00000598067	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		19.02	■□□□□ 0.64
FCHO1-223	ENST00000598067	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		19.02	■□□□□ 0.64
FCHO1-223	ENST00000598067	STAC3	Q96MF2	364 aa		19.01	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	CDK19	Q9BWU1	502 aa		19.01	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		18.99	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		18.98	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		18.98	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		18.98	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		18.97	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		18.97	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		18.97	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		18.96	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	CHRNA2	Q15822	529 aa		18.96	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	CCDC125	Q86Z20	511 aa		18.96	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	ACE	P12821	1306 aa		18.96	■□□□□ 0.63
FCHO1-223	ENST00000598067	KIAA0232	Q92628	1395 aa		18.95	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	FAM182B	Q5T319	152 aa		18.95	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	STRN4	Q9NRL3	753 aa		18.94	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		18.93	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		18.92	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	CABP2	Q9NPB3	220 aa		18.92	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	NEUROD1	Q13562	356 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	RGPD5	Q99666	1765 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	AKAP12	Q02952	1782 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FCHO1-223	ENST00000598067	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	ABTB2	Q8N961	1025 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	USP35	Q9P2H5	1018 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	PIK3C2A	O00443	1686 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		18.86	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		18.86	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		18.85	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		18.84	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	EVA1C	P58658	441 aa		18.84	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	SSH2	Q76I76	1423 aa		18.83	■□□□□ 0.61
FCHO1-223	ENST00000598067	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	BAG6	P46379	1132 aa		18.83	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	CABP1	Q9NZU7	370 aa		18.82	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	USP19	O94966	1318 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	USP6	P35125	1406 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	COL18A1	P39060	1754 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	NLRP13	Q86W25	1043 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	SLIT3	O75094	1523 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	SBF2	Q86WG5	1849 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	LRP5	O75197	1615 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	EVC2	Q86UK5	1308 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	TRIM37	O94972	964 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	GC	P02774	474 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	NLRP6	P59044	892 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	CPD	O75976	1380 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-223	ENST00000598067	RREB1	Q92766	1687 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	LRRC37A3	O60309	1634 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	SOX12	O15370	315 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	LTN1	O94822	1766 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	PDE3B	Q13370	1112 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	PEAK1	Q9H792	1746 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-223	ENST00000598067	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	APBA3	O96018	575 aa		18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	CRB1	P82279	1406 aa		18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	DISP2	A7MBM2	1401 aa		18.69	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		18.69	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	NFAT5	O94916	1531 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-223	ENST00000598067	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		18.67	■□□□□ 0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms