RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 NUP160Q12769 1436 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 J3QL48 77 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 SHROOM2Q13796 1616 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 GUCA2AQ02747 115 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 IRF6O14896 467 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 HOXA2O43364 376 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 WFS1O76024 890 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 SKOR1P84550 965 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 HPS1Q92902 700 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-212ENST00000597259 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.47□□□□□ -0.89
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HERC3-212ENST00000597259 CCDC102AQ96A19 550 aa9.45□□□□□ -0.9
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HERC3-212ENST00000597259 LCE2CQ5TA81 110 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 BCANQ96GW7 911 aa9.42□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
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HERC3-212ENST00000597259 JUNDP17535 347 aa9.41□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 TRIM47Q96LD4 638 aa9.41□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 WNT7BP56706 349 aa9.4□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.4□□□□□ -0.9
HERC3-212ENST00000597259 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 CUL7Q14999 1698 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 ALDH1A1P00352 501 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 CLCN1P35523 988 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 SENP2Q9HC62 589 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.37□□□□□ -0.91
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HERC3-212ENST00000597259 RETREG3Q86VR2 466 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-212ENST00000597259 KIF27Q86VH2 1401 aa9.35□□□□□ -0.91
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HERC3-212ENST00000597259 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 FDX1P10109 184 aa9.33□□□□□ -0.92
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HERC3-212ENST00000597259 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 C6orf229H3BNL8 230 aa9.32□□□□□ -0.92
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HERC3-212ENST00000597259 SH3BP2P78314 561 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-212ENST00000597259 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 STK17AQ9UEE5 414 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 MS4A1P11836 297 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 NDUFV2P19404 249 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-212ENST00000597259 LINC01559Q495D7 138 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-212ENST00000597259 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 MAPKBP1O60336 1514 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 DISP1Q96F81 1524 aa9.26□□□□□ -0.93
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HERC3-212ENST00000597259 DIP2BQ9P265 1576 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 VEGFBP49765 207 aa9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-212ENST00000597259 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
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HERC3-212ENST00000597259 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 ZNF511Q8NB15 262 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 PRXQ9BXM0 1461 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 KIAA0556O60303 1618 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-212ENST00000597259 GMPRP36959 345 aa9.21□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 MTMR2Q13614 643 aa9.21□□□□□ -0.94
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