RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593111.1

PSME3-216, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-216ENST00000593111 STAC3Q96MF2 364 aa25.58■■□□□ 1.69
PSME3-216ENST00000593111 BAG6P46379 1132 aa25.57■■□□□ 1.68
PSME3-216ENST00000593111 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.57■■□□□ 1.68
PSME3-216ENST00000593111 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PSME3-216ENST00000593111 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.55■■□□□ 1.68
PSME3-216ENST00000593111 ALS2Q96Q42 1657 aa25.55■■□□□ 1.68
PSME3-216ENST00000593111 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PSME3-216ENST00000593111 FAM182BQ5T319 152 aa25.53■■□□□ 1.68
PSME3-216ENST00000593111 NRAPQ86VF7 1730 aa25.53■■□□□ 1.68
PSME3-216ENST00000593111 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.53■■□□□ 1.68
PSME3-216ENST00000593111 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.53■■□□□ 1.68
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PSME3-216ENST00000593111 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PSME3-216ENST00000593111 CHRNA2Q15822 529 aa25.48■■□□□ 1.67
PSME3-216ENST00000593111 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.48■■□□□ 1.67
PSME3-216ENST00000593111 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PSME3-216ENST00000593111 STRN4Q9NRL3 753 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME3-216ENST00000593111 KIAA0232Q92628 1395 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME3-216ENST00000593111 HRCP23327 699 aa25.46■■□□□ 1.67
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PSME3-216ENST00000593111 ITSN1Q15811 1721 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME3-216ENST00000593111 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PSME3-216ENST00000593111 EVA1CP58658 441 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME3-216ENST00000593111 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME3-216ENST00000593111 ACEP12821 1306 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME3-216ENST00000593111 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME3-216ENST00000593111 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME3-216ENST00000593111 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME3-216ENST00000593111 USP35Q9P2H5 1018 aa25.41■■□□□ 1.66
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PSME3-216ENST00000593111 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.37■■□□□ 1.65
PSME3-216ENST00000593111 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.37■■□□□ 1.65
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PSME3-216ENST00000593111 APBA3O96018 575 aa25.33■■□□□ 1.65
PSME3-216ENST00000593111 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PSME3-216ENST00000593111 NLRP13Q86W25 1043 aa25.31■■□□□ 1.64
PSME3-216ENST00000593111 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.31■■□□□ 1.64
PSME3-216ENST00000593111 DISP2A7MBM2 1401 aa25.3■■□□□ 1.64
PSME3-216ENST00000593111 BARGINQ6ZT62 677 aa25.3■■□□□ 1.64
PSME3-216ENST00000593111 SSH2Q76I76 1423 aa25.29■■□□□ 1.64
PSME3-216ENST00000593111 CABP2Q9NPB3 220 aa25.29■■□□□ 1.64
PSME3-216ENST00000593111 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.29■■□□□ 1.64
PSME3-216ENST00000593111 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PSME3-216ENST00000593111 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.28■■□□□ 1.64
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PSME3-216ENST00000593111 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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PSME3-216ENST00000593111 NLRP6P59044 892 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME3-216ENST00000593111 NBPF14Q5TI25 921 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME3-216ENST00000593111 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME3-216ENST00000593111 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PSME3-216ENST00000593111 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PSME3-216ENST00000593111 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.14■■□□□ 1.62
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PSME3-216ENST00000593111 CRB1P82279 1406 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME3-216ENST00000593111 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PSME3-216ENST00000593111 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME3-216ENST00000593111 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME3-216ENST00000593111 EVC2Q86UK5 1308 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME3-216ENST00000593111 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.11■■□□□ 1.61
PSME3-216ENST00000593111 DDB1Q16531 1140 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME3-216ENST00000593111 RREB1Q92766 1687 aa25.08■■□□□ 1.61
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PSME3-216ENST00000593111 SOX12O15370 315 aa25.07■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.07■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.06■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.06■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.06■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.06■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 SLIT3O75094 1523 aa25.06■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 NEUROD1Q13562 356 aa25.05■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 SPON1Q9HCB6 807 aa25.05■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.04■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.04■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.03■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.03■■□□□ 1.6
PSME3-216ENST00000593111 PLSCR1O15162 318 aa25.02■■□□□ 1.6
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