RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JS52 829 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-211ENST00000590874 MYT1Q01538 1121 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-211ENST00000590874 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.57■■■■□ 3.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP7BP35670 1465 aa37.57■■■■□ 3.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-211ENST00000590874 HRCP23327 699 aa37.51■■■■□ 3.6
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM11Q9NQV5 511 aa37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ITSN1Q15811 1721 aa37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0232Q92628 1395 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-211ENST00000590874 BAG6P46379 1132 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM182BQ5T319 152 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK19Q9BWU1 502 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-211ENST00000590874 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNA2Q15822 529 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-211ENST00000590874 NUTM2GQ5VZR2 741 aa37.38■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ACEP12821 1306 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC61Q9Y6R9 512 aa37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF8Q3BBV2 869 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 STRN4Q9NRL3 753 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RGPD1P0DJD0 1748 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP5O75197 1615 aa37.32■■■■□ 3.57
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF1Q3BBV0 1214 aa37.31■■■■□ 3.56
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHG3A1L390 1219 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-211ENST00000590874 NRKQ7Z2Y5 1582 aa37.28■■■■□ 3.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DISP2A7MBM2 1401 aa37.27■■■■□ 3.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SSH2Q76I76 1423 aa37.24■■■■□ 3.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ABTB2Q8N961 1025 aa37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-211ENST00000590874 USP35Q9P2H5 1018 aa37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-211ENST00000590874 USP19O94966 1318 aa37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa37.2■■■■□ 3.55
CAPNS1-211ENST00000590874 EVA1CP58658 441 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CPDO75976 1380 aa37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM37O94972 964 aa37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM196AQ6ZSG2 479 aa37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 LMO7Q8WWI1 1683 aa37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 BARGINQ6ZT62 677 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CABP2Q9NPB3 220 aa37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMKK2Q96RR4 588 aa37.13■■■■□ 3.53
CAPNS1-211ENST00000590874 GCP02774 474 aa37.11■■■■□ 3.53
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP13Q86W25 1043 aa37.11■■■■□ 3.53
CAPNS1-211ENST00000590874 TCP11L2Q8N4U5 519 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-211ENST00000590874 QRICH2Q9H0J4 1663 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-211ENST00000590874 APBA3O96018 575 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE3BQ13370 1112 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-211ENST00000590874 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-211ENST00000590874 USP6P35125 1406 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-211ENST00000590874 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CABP1Q9NZU7 370 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PARD3Q8TEW0 1356 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-211ENST00000590874 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-211ENST00000590874 L3MBTL2Q969R5 705 aa37■■■■□ 3.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SLIT3O75094 1523 aa37■■■■□ 3.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP6P59044 892 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RREB1Q92766 1687 aa36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-211ENST00000590874 CRB1P82279 1406 aa36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-211ENST00000590874 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP188Q5SRE5 1749 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3C2AO00443 1686 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.92■■■■□ 3.5
CAPNS1-211ENST00000590874 EVC2Q86UK5 1308 aa36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC37A3O60309 1634 aa36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 PEAK1Q9H792 1746 aa36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 COL18A1P39060 1754 aa36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF14Q5TI25 921 aa36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-211ENST00000590874 DDB1Q16531 1140 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR17Q8IZU2 1322 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-211ENST00000590874 NEUROD1Q13562 356 aa36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.3 ms