RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 LTKP29376 864 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFYVE9O95405 1425 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 IQGAP1P46940 1657 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF3CO14782 793 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 HRO43593 1189 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 BCANQ96GW7 911 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 MYOM2P54296 1465 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 SLIT1O75093 1534 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3C2GO75747 1445 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-208ENST00000589162 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf72A6NCS6 295 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 ALKQ9UM73 1620 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 STK26Q9P289 416 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 TMC2Q8TDI7 906 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 EID1Q9Y6B2 187 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 METP08581 1390 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRB1O14514 1584 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 STRCQ7RTU9 1775 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRUQ92729 1446 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 USP47Q96K76 1375 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMC1P11047 1609 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.53□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CAPNS1-208ENST00000589162 MED14O60244 1454 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0G2JS52 829 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D12O60347 775 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAM1Q96QH2 718 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 TBX22Q9Y458 520 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 DIP2AQ14689 1571 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNA6P17658 529 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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