RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
SCAMP4-210ENST00000588555 NME9Q86XW9 330 aa35.05■■■■□ 3.2
SCAMP4-210ENST00000588555 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.04■■■■□ 3.2
SCAMP4-210ENST00000588555 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
SCAMP4-210ENST00000588555 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.01■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 MST1RQ04912 1400 aa34.99■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.98■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.98■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.97■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 MSH6P52701 1360 aa34.97■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 ATF3P18847 181 aa34.96■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.96■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.96■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 MTHFSP49914 203 aa34.95■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 ORAI2Q96SN7 254 aa34.95■■■■□ 3.19
SCAMP4-210ENST00000588555 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.18
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF1AQ12756 1690 aa34.94■■■■□ 3.18
SCAMP4-210ENST00000588555 PIK3C2AO00443 1686 aa34.93■■■■□ 3.18
SCAMP4-210ENST00000588555 COG3Q96JB2 828 aa34.93■■■■□ 3.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.92■■■■□ 3.18
SCAMP4-210ENST00000588555 INSRP06213 1382 aa34.92■■■■□ 3.18
SCAMP4-210ENST00000588555 SHPRHQ149N8 1683 aa34.9■■■■□ 3.18
SCAMP4-210ENST00000588555 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.89■■■■□ 3.18
SCAMP4-210ENST00000588555 USP31Q70CQ4 1352 aa34.88■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 USP54Q70EL1 1684 aa34.88■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAMTS8Q9UP79 889 aa34.85■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 FBLN1P23142 703 aa34.84■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 POLKQ9UBT6 870 aa34.84■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP34.83■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 CFAP53Q96M91 514 aa34.83■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.83■■■■□ 3.17
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXO3O43524 673 aa34.82■■■■□ 3.16
SCAMP4-210ENST00000588555 PSME1Q06323 249 aa34.82■■■■□ 3.16
SCAMP4-210ENST00000588555 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
SCAMP4-210ENST00000588555 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.78■■■■□ 3.16
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBED9Q6R2W3 1325 aa34.77■■■■□ 3.16
SCAMP4-210ENST00000588555 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
SCAMP4-210ENST00000588555 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
SCAMP4-210ENST00000588555 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.75■■■■□ 3.15
SCAMP4-210ENST00000588555 ABTB2Q8N961 1025 aa34.74■■■■□ 3.15
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRP6P59044 892 aa34.74■■■■□ 3.15
SCAMP4-210ENST00000588555 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
SCAMP4-210ENST00000588555 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.71■■■■□ 3.15
SCAMP4-210ENST00000588555 SLAIN2Q9P270 581 aa34.69■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.68■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 BRINP3Q76B58 766 aa34.68■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 PEAK1Q9H792 1746 aa34.67■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 ALS2Q96Q42 1657 aa34.67■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.66■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 PXDNQ92626 1479 aa34.65■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa34.64■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
SCAMP4-210ENST00000588555 NUDCQ9Y266 331 aa34.62■■■■□ 3.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SBNO1A3KN83 1393 aa34.62■■■■□ 3.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.61■■■■□ 3.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SOX12O15370 315 aa34.61■■■■□ 3.13
SCAMP4-210ENST00000588555 NFAT5O94916 1531 aa34.6■■■■□ 3.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC146Q8IYE0 955 aa34.59■■■■□ 3.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SLIT3O75094 1523 aa34.59■■■■□ 3.13
SCAMP4-210ENST00000588555 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
SCAMP4-210ENST00000588555 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
SCAMP4-210ENST00000588555 IL13P35225 146 aa34.57■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 USP19O94966 1318 aa34.56■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.55■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FLT4P35916 1363 aa34.54■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.54■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.52■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.52■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.51■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 RUNDC1Q96C34 613 aa34.51■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 LTN1O94822 1766 aa34.51■■■■□ 3.12
SCAMP4-210ENST00000588555 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.51■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.51■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 APAF1O14727 1248 aa34.5■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.5■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHF1Q96S99 279 aa34.47■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 RTL1A6NKG5 1358 aa34.47■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 GCP02774 474 aa34.46■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 AMPHP49418 695 aa34.46■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.46■■■■□ 3.11
SCAMP4-210ENST00000588555 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.45■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 HOXC9P31274 260 aa34.44■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF10O15013 1369 aa34.44■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF521Q96K83 1311 aa34.43■■■■□ 3.1
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