RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583763.1

CSAG4-202, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene CSAG4, Length 237 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-202ENST00000583763 ARHGEF10O15013 1369 aa15.12■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 TECPR2O15040 1411 aa15.12■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.12■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.12■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 PROM2Q8N271 834 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG4-202ENST00000583763 ALS2Q96Q42 1657 aa15.08■□□□□ 0
CSAG4-202ENST00000583763 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CSAG4-202ENST00000583763 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.07■□□□□ 0
CSAG4-202ENST00000583763 KIF1BO60333 1816 aa15.06■□□□□ 0
CSAG4-202ENST00000583763 PLSCR1O15162 318 aa15.06■□□□□ 0
CSAG4-202ENST00000583763 BARGINQ6ZT62 677 aa15.06■□□□□ 0
CSAG4-202ENST00000583763 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.06■□□□□ 0
CSAG4-202ENST00000583763 DLC1Q96QB1 1528 aa15.06■□□□□ 0
CSAG4-202ENST00000583763 STK26Q9P289 416 aa15.05■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 ABCC11Q96J66 1382 aa15.05■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 PPLO60437 1756 aa15.04■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 PDE3BQ13370 1112 aa15.04■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 PEAK1Q9H792 1746 aa15.03■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 IFT172Q9UG01 1749 aa15.03■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 MAP3K5Q99683 1374 aa15.03■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 ROCK1Q13464 1354 aa15.02■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.02■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 HSPA6P17066 643 aa15.02■□□□□ -0
CSAG4-202ENST00000583763 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.02□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.01□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 SBF2Q86WG5 1849 aa15.01□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 CHRNA2Q15822 529 aa15□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 PRDM11Q9NQV5 511 aa15□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 USP35Q9P2H5 1018 aa15□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 KIAA0232Q92628 1395 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 MTFR1LQ9H019 292 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 STRN4Q9NRL3 753 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 ARXQ96QS3 562 aa14.98□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 GPR162Q16538 588 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 SIRT1Q96EB6 747 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 SLC15A2Q16348 729 aa14.96□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 SSH2Q76I76 1423 aa14.96□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CSAG4-202ENST00000583763 SLC34A2O95436 690 aa14.95□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.95□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.94□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 ATP10DQ9P241 1426 aa14.92□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.92□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 TXNRD1Q16881 649 aa14.91□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.91□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.91□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.91□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.91□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 ATP7BP35670 1465 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 CAPN15O75808 1086 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 STK32BQ9NY57 414 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG4-202ENST00000583763 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 PRELPP51888 382 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 PCNTO95613 3336 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 EVA1CP58658 441 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 LRRC37A3O60309 1634 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 ADCY9O60503 1353 aa14.86□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 BCL9O00512 1426 aa14.86□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 PIK3C2GO75747 1445 aa14.86□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 PAPPAQ13219 1627 aa14.86□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.86□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.85□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 APLP2Q06481 763 aa14.84□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 PRAM1Q96QH2 718 aa14.84□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CSAG4-202ENST00000583763 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CSAG4-202ENST00000583763 KIF3CO14782 793 aa14.82□□□□□ -0.04
CSAG4-202ENST00000583763 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.82□□□□□ -0.04
CSAG4-202ENST00000583763 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF827Q17R98 1081 aa14.81□□□□□ -0.04
CSAG4-202ENST00000583763 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.81□□□□□ -0.04
CSAG4-202ENST00000583763 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CSAG4-202ENST00000583763 CPDO75976 1380 aa14.81□□□□□ -0.04
CSAG4-202ENST00000583763 GRIN3BO60391 1043 aa14.8□□□□□ -0.04
CSAG4-202ENST00000583763 APLP1P51693 650 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms