RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580361.1

RAB31-208, Transcript of RAB31, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAB31, Length 367 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB31-208	ENST00000580361	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	WNT7A	O00755	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	CTH	P32929	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	NBPF14	Q5TI25	921 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	GDF9	O60383	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	MPND	Q8N594	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	BAP1	Q92560	729 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	SH3BP2	P78314	561 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	SKOR1	P84550	965 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	NR6A1	Q15406	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	GFRA3	O60609	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	PTK2	Q05397	1052 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	FLII	Q13045	1269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	SIAH2	O43255	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	DGAT1	O75907	488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	FOXC1	Q12948	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	CYP4X1	Q8N118	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	MCM6	Q14566	821 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	CDK15	Q96Q40	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB31-208	ENST00000580361	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	TNFRSF10A	O00220	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	AVP	P01185	164 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	AGER	Q15109	404 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	ZBBX	A8MT70	800 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	ZBTB33	Q86T24	672 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	GPR37L1	O60883	481 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	ADH1C	P00326	375 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	SMPD1	P17405	629 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	NR5A1	Q13285	461 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	PKDCC	Q504Y2	493 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	TRIM52	Q96A61	297 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	FAM187A	A6NFU0	413 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	ALDH1A1	P00352	501 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	NR1H3	Q13133	447 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	ADAM32	Q8TC27	787 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	RAD21	O60216	631 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361		J3QL48	77 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	FBXO45	P0C2W1	286 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	MYT1	Q01538	1121 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RAB31-208	ENST00000580361	COG6	Q9Y2V7	657 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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