RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 LAMC1P11047 1609 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 TESK2Q96S53 571 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 POGKQ9P215 609 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 C7P10643 843 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 METRNQ9UJH8 293 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 TMEM94Q12767 1356 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 ABCC11Q96J66 1382 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 CCDC7Q96M83 1385 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 TMF1P82094 1093 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 TECPR2O15040 1411 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 DLC1Q96QB1 1528 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 NUTM2FA1L443 756 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 PSEN1P49768 467 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 CABP2Q9NPB3 220 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 PTCH1Q13635 1447 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 IER5LQ5T953 404 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 TOM1O60784 492 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 C14orf37Q86TY3 774 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 CDK19Q9BWU1 502 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 EVC2Q86UK5 1308 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 MSH6P52701 1360 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 SIRT1Q96EB6 747 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 DCCP43146 1447 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 TMC1Q8TDI8 760 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS3-210ENST00000568468 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 SEC24BO95487 1268 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 PIP4K2BP78356 416 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 CDCA8Q53HL2 280 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 PANK3Q9H999 370 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 GOLGA2Q08379 1002 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 CABP1Q9NZU7 370 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 SLAIN2Q9P270 581 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 MST1RQ04912 1400 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 ADGRB2O60241 1585 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 ATP7BP35670 1465 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 POTEB2H3BUK9 544 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 ATF3P18847 181 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 HSPA1LP34931 641 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 SLC24A1O60721 1099 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-210ENST00000568468 MYOM1P52179 1685 aa8.34□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 POTEFA5A3E0 1075 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 PLCG2P16885 1265 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 ORAI2Q96SN7 254 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 A0A1W2PP64 1363 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 STK25O00506 426 aa8.32□□□□□ -1.08
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