RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
PBX1-217ENST00000559578 ITSN1Q15811 1721 aa34.86■■■■□ 3.17
PBX1-217ENST00000559578 NRAPQ86VF7 1730 aa34.86■■■■□ 3.17
PBX1-217ENST00000559578 A0A0G2JS52 829 aa34.85■■■■□ 3.17
PBX1-217ENST00000559578 MYT1Q01538 1121 aa34.85■■■■□ 3.17
PBX1-217ENST00000559578 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
PBX1-217ENST00000559578 ATP7BP35670 1465 aa34.82■■■■□ 3.16
PBX1-217ENST00000559578 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.81■■■■□ 3.16
PBX1-217ENST00000559578 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
PBX1-217ENST00000559578 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.79■■■■□ 3.16
PBX1-217ENST00000559578 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.78■■■■□ 3.16
PBX1-217ENST00000559578 CDK19Q9BWU1 502 aa34.77■■■■□ 3.16
PBX1-217ENST00000559578 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.75■■■■□ 3.15
PBX1-217ENST00000559578 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.75■■■■□ 3.15
PBX1-217ENST00000559578 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.73■■■■□ 3.15
PBX1-217ENST00000559578 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.73■■■■□ 3.15
PBX1-217ENST00000559578 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.7■■■■□ 3.15
PBX1-217ENST00000559578 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 BAG6P46379 1132 aa34.68■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.68■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 KIAA0232Q92628 1395 aa34.68■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 ACEP12821 1306 aa34.67■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.66■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.64■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.64■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.64■■■■□ 3.14
PBX1-217ENST00000559578 CHRNA2Q15822 529 aa34.63■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa34.62■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 STRN4Q9NRL3 753 aa34.61■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.6■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.6■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 FAM182BQ5T319 152 aa34.59■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 ABTB2Q8N961 1025 aa34.59■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.13
PBX1-217ENST00000559578 EVA1CP58658 441 aa34.55■■■■□ 3.12
PBX1-217ENST00000559578 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.54■■■■□ 3.12
PBX1-217ENST00000559578 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.53■■■■□ 3.12
PBX1-217ENST00000559578 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
PBX1-217ENST00000559578 NLRP13Q86W25 1043 aa34.5■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 CABP2Q9NPB3 220 aa34.5■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 USP35Q9P2H5 1018 aa34.5■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 SSH2Q76I76 1423 aa34.49■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.49■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 USP19O94966 1318 aa34.49■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 CPDO75976 1380 aa34.49■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.47■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 BARGINQ6ZT62 677 aa34.47■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 LRP5O75197 1615 aa34.47■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 DISP2A7MBM2 1401 aa34.47■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.45■■■■□ 3.11
PBX1-217ENST00000559578 GCP02774 474 aa34.43■■■■□ 3.1
PBX1-217ENST00000559578 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
PBX1-217ENST00000559578 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.43■■■■□ 3.1
PBX1-217ENST00000559578 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.43■■■■□ 3.1
PBX1-217ENST00000559578 PDE3BQ13370 1112 aa34.42■■■■□ 3.1
PBX1-217ENST00000559578 TRIM37O94972 964 aa34.41■■■■□ 3.1
PBX1-217ENST00000559578 TCP11L2Q8N4U5 519 aa34.41■■■■□ 3.1
PBX1-217ENST00000559578 CABP1Q9NZU7 370 aa34.41■■■■□ 3.1
PBX1-217ENST00000559578 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 USP6P35125 1406 aa34.38■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 EVC2Q86UK5 1308 aa34.36■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 NLRP6P59044 892 aa34.36■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 APBA3O96018 575 aa34.34■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 CAMKK2Q96RR4 588 aa34.34■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.33■■■■□ 3.09
PBX1-217ENST00000559578 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.32■■■■□ 3.08
PBX1-217ENST00000559578 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.32■■■■□ 3.08
PBX1-217ENST00000559578 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.32■■■■□ 3.08
PBX1-217ENST00000559578 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
PBX1-217ENST00000559578 SLIT3O75094 1523 aa34.29■■■■□ 3.08
PBX1-217ENST00000559578 CRB1P82279 1406 aa34.29■■■■□ 3.08
PBX1-217ENST00000559578 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.27■■■■□ 3.08
PBX1-217ENST00000559578 NEUROD1Q13562 356 aa34.27■■■■□ 3.08
PBX1-217ENST00000559578 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
PBX1-217ENST00000559578 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
PBX1-217ENST00000559578 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
PBX1-217ENST00000559578 PIK3C2AO00443 1686 aa34.24■■■■□ 3.07
PBX1-217ENST00000559578 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.2■■■■□ 3.07
PBX1-217ENST00000559578 RREB1Q92766 1687 aa34.19■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.18■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.18■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 AKAP12Q02952 1782 aa34.18■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 COL18A1P39060 1754 aa34.17■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 NBPF14Q5TI25 921 aa34.17■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.16■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.16■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.16■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.16■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 DDB1Q16531 1140 aa34.15■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms