RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554669.5

LINC01578-203, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01578, Length 578 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01578-203ENST00000554669 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
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LINC01578-203ENST00000554669 CABP1Q9NZU7 370 aa40.76■■■■■ 4.12
LINC01578-203ENST00000554669 SLIT2O94813 1529 aa40.72■■■■■ 4.11
LINC01578-203ENST00000554669 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
LINC01578-203ENST00000554669 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa40.72■■■■■ 4.11
LINC01578-203ENST00000554669 ATRNO75882 1429 aa40.71■■■■■ 4.11
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LINC01578-203ENST00000554669 TESK2Q96S53 571 aa40.63■■■■■ 4.09
LINC01578-203ENST00000554669 RGS12O14924 1447 aa40.62■■■■■ 4.09
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LINC01578-203ENST00000554669 ATAD2Q6PL18 1390 aa40.61■■■■■ 4.09
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LINC01578-203ENST00000554669 ABTB2Q8N961 1025 aa40.57■■■■■ 4.09
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LINC01578-203ENST00000554669 NWD2Q9ULI1 1742 aa40.52■■■■■ 4.08
LINC01578-203ENST00000554669 AKAP12Q02952 1782 aa40.51■■■■■ 4.07
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LINC01578-203ENST00000554669 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
LINC01578-203ENST00000554669 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.49■■■■■ 4.07
LINC01578-203ENST00000554669 KIAA0232Q92628 1395 aa40.48■■■■■ 4.07
LINC01578-203ENST00000554669 NRKQ7Z2Y5 1582 aa40.48■■■■■ 4.07
LINC01578-203ENST00000554669 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
LINC01578-203ENST00000554669 BTG4Q9NY30 223 aa40.47■■■■■ 4.07
LINC01578-203ENST00000554669 NRAPQ86VF7 1730 aa40.47■■■■■ 4.07
LINC01578-203ENST00000554669 PIK3C2AO00443 1686 aa40.46■■■■■ 4.07
LINC01578-203ENST00000554669 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
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LINC01578-203ENST00000554669 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
LINC01578-203ENST00000554669 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa40.44■■■■■ 4.06
LINC01578-203ENST00000554669 NLRP13Q86W25 1043 aa40.44■■■■■ 4.06
LINC01578-203ENST00000554669 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.44■■■■■ 4.06
LINC01578-203ENST00000554669 PRDM11Q9NQV5 511 aa40.44■■■■■ 4.06
LINC01578-203ENST00000554669 CHRNA2Q15822 529 aa40.42■■■■■ 4.06
LINC01578-203ENST00000554669 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
LINC01578-203ENST00000554669 NLRP6P59044 892 aa40.4■■■■■ 4.06
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LINC01578-203ENST00000554669 TTC21AQ8NDW8 1320 aa40.35■■■■■ 4.05
LINC01578-203ENST00000554669 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.052e-7■■■■■ 44.5
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LINC01578-203ENST00000554669 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
LINC01578-203ENST00000554669 A0A1W2PP64 1363 aa40.32■■■■■ 4.04
LINC01578-203ENST00000554669 LMO7Q8WWI1 1683 aa40.29■■■■■ 4.04
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LINC01578-203ENST00000554669 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
LINC01578-203ENST00000554669 CDCA8Q53HL2 280 aa40.28■■■■■ 4.04
LINC01578-203ENST00000554669 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
LINC01578-203ENST00000554669 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
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LINC01578-203ENST00000554669 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa40.25■■■■■ 4.03
LINC01578-203ENST00000554669 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.25■■■■■ 4.03
LINC01578-203ENST00000554669 NME9Q86XW9 330 aa40.24■■■■■ 4.03
LINC01578-203ENST00000554669 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
LINC01578-203ENST00000554669 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
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LINC01578-203ENST00000554669 USP31Q70CQ4 1352 aa40.22■■■■■ 4.03
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LINC01578-203ENST00000554669 USP54Q70EL1 1684 aa40.17■■■■■ 4.02
LINC01578-203ENST00000554669 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa40.16■■■■■ 4.02
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LINC01578-203ENST00000554669 SOX12O15370 315 aa40.15■■■■■ 4.02
LINC01578-203ENST00000554669 ARHGEF25Q86VW2 580 aa40.15■■■■■ 4.02
LINC01578-203ENST00000554669 COL18A1P39060 1754 aa40.15■■■■■ 4.02
LINC01578-203ENST00000554669 EP400Q96L91 3159 aa40.15■■■■■ 4.02
LINC01578-203ENST00000554669 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
LINC01578-203ENST00000554669 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
LINC01578-203ENST00000554669 KCNH5Q8NCM2 988 aa40.14■■■■■ 4.02
LINC01578-203ENST00000554669 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa40.13■■■■■ 4.02
LINC01578-203ENST00000554669 EVA1CP58658 441 aa40.12■■■■■ 4.01
LINC01578-203ENST00000554669 AXIN2Q9Y2T1 843 aa40.12■■■■■ 4.01
LINC01578-203ENST00000554669 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
LINC01578-203ENST00000554669 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa40.09■■■■■ 4.01
LINC01578-203ENST00000554669 OVOS2Q6IE36 1432 aa40.09■■■■■ 4.01
LINC01578-203ENST00000554669 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa40.09■■■■■ 4.01
LINC01578-203ENST00000554669 MYOM1P52179 1685 aa40.07■■■■■ 4
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