RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 LRP5O75197 1615 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.65■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.64■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.64■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
PRRX1-208ENST00000553786 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.63■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 FAM182BQ5T319 152 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 ATP7BP35670 1465 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 STAC3Q96MF2 364 aa24.59■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 ITSN1Q15811 1721 aa24.58■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 KIAA0232Q92628 1395 aa24.58■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 HRCP23327 699 aa24.58■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PRRX1-208ENST00000553786 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
PRRX1-208ENST00000553786 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PRRX1-208ENST00000553786 DISP2A7MBM2 1401 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRX1-208ENST00000553786 CHRNA2Q15822 529 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRX1-208ENST00000553786 STRN4Q9NRL3 753 aa24.54■■□□□ 1.52
PRRX1-208ENST00000553786 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.54■■□□□ 1.52
PRRX1-208ENST00000553786 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PRRX1-208ENST00000553786 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.52■■□□□ 1.52
PRRX1-208ENST00000553786 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
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PRRX1-208ENST00000553786 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 CDK19Q9BWU1 502 aa24.5■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 ACEP12821 1306 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 TRIM37O94972 964 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 USP35Q9P2H5 1018 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 SSH2Q76I76 1423 aa24.46■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.46■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.46■■□□□ 1.51
PRRX1-208ENST00000553786 EVA1CP58658 441 aa24.45■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.44■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.43■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.42■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.42■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 APBA3O96018 575 aa24.42■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 PDE3BQ13370 1112 aa24.42■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 BARGINQ6ZT62 677 aa24.42■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 ABTB2Q8N961 1025 aa24.42■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 CPDO75976 1380 aa24.41■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.4■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 USP19O94966 1318 aa24.4■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.39■■□□□ 1.5
PRRX1-208ENST00000553786 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.38■■□□□ 1.49
PRRX1-208ENST00000553786 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.38■■□□□ 1.49
PRRX1-208ENST00000553786 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PRRX1-208ENST00000553786 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.36■■□□□ 1.49
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PRRX1-208ENST00000553786 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PRRX1-208ENST00000553786 RREB1Q92766 1687 aa24.34■■□□□ 1.49
PRRX1-208ENST00000553786 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PRRX1-208ENST00000553786 GCP02774 474 aa24.33■■□□□ 1.49
PRRX1-208ENST00000553786 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PRRX1-208ENST00000553786 CABP2Q9NPB3 220 aa24.31■■□□□ 1.48
PRRX1-208ENST00000553786 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRX1-208ENST00000553786 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRX1-208ENST00000553786 NBPF14Q5TI25 921 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRX1-208ENST00000553786 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PRRX1-208ENST00000553786 CRB1P82279 1406 aa24.28■■□□□ 1.48
PRRX1-208ENST00000553786 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PRRX1-208ENST00000553786 USP6P35125 1406 aa24.27■■□□□ 1.48
PRRX1-208ENST00000553786 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.26■■□□□ 1.47
PRRX1-208ENST00000553786 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.26■■□□□ 1.47
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PRRX1-208ENST00000553786 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.26■■□□□ 1.47
PRRX1-208ENST00000553786 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PRRX1-208ENST00000553786 NLRP6P59044 892 aa24.25■■□□□ 1.47
PRRX1-208ENST00000553786 CABP1Q9NZU7 370 aa24.24■■□□□ 1.47
PRRX1-208ENST00000553786 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.24■■□□□ 1.47
PRRX1-208ENST00000553786 SLIT3O75094 1523 aa24.24■■□□□ 1.47
PRRX1-208ENST00000553786 LRRC37A3O60309 1634 aa24.21■■□□□ 1.47
PRRX1-208ENST00000553786 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.2■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 PEAK1Q9H792 1746 aa24.2■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 DDB1Q16531 1140 aa24.19■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 SPON1Q9HCB6 807 aa24.19■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 PIK3C2AO00443 1686 aa24.18■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 EVC2Q86UK5 1308 aa24.16■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.15■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 KCNQ2O43526 872 aa24.15■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.15■■□□□ 1.46
PRRX1-208ENST00000553786 PLSCR1O15162 318 aa24.13■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.13■■□□□ 1.45
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