RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 SLIT2O94813 1529 aa25.28■■□□□ 1.64
CS-219ENST00000550655 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.28■■□□□ 1.64
CS-219ENST00000550655 AKAP12Q02952 1782 aa25.28■■□□□ 1.64
CS-219ENST00000550655 ATRNO75882 1429 aa25.28■■□□□ 1.64
CS-219ENST00000550655 EVC2Q86UK5 1308 aa25.27■■□□□ 1.64
CS-219ENST00000550655 RXRBP28702 533 aa25.26■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 USP21Q9UK80 565 aa25.26■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 NRAPQ86VF7 1730 aa25.25■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 RGS12O14924 1447 aa25.24■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 PLEKHG5O94827 1062 aa25.23■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.22■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CS-219ENST00000550655 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 USP6P35125 1406 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 CABP1Q9NZU7 370 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 GLI3P10071 1580 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 PIK3C2AO00443 1686 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 SSH2Q76I76 1423 aa25.16■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-219ENST00000550655 FAM83GA6ND36 823 aa25.13■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.12■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 USP19O94966 1318 aa25.12■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 TESK2Q96S53 571 aa25.11■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.1■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 SLIT3O75094 1523 aa25.1■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 USP47Q96K76 1375 aa25.09■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.09■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 ABTB2Q8N961 1025 aa25.09■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.09■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 KIAA0232Q92628 1395 aa25.08■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CS-219ENST00000550655 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.07■■□□□ 1.6
CS-219ENST00000550655 USP54Q70EL1 1684 aa25.07■■□□□ 1.6
CS-219ENST00000550655 VPS72Q15906 364 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-219ENST00000550655 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CS-219ENST00000550655 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-219ENST00000550655 BTG4Q9NY30 223 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-219ENST00000550655 NLRP13Q86W25 1043 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-219ENST00000550655 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CS-219ENST00000550655 CPDO75976 1380 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-219ENST00000550655 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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CS-219ENST00000550655 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 CHRNA2Q15822 529 aa25■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 COL18A1P39060 1754 aa24.99■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
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CS-219ENST00000550655 GCP02774 474 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 NLRP6P59044 892 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 MYOM1P52179 1685 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 NFAT5O94916 1531 aa24.96■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 SLC24A1O60721 1099 aa24.96■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 TMC1Q8TDI8 760 aa24.96■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
CS-219ENST00000550655 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 EP400Q96L91 3159 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 RGPD5Q99666 1765 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 USP31Q70CQ4 1352 aa24.92■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 TMF1P82094 1093 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 LTN1O94822 1766 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
CS-219ENST00000550655 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.89■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 NME9Q86XW9 330 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 STRN4Q9NRL3 753 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 ABCC6O95255 1503 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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CS-219ENST00000550655 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.84■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.83■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CS-219ENST00000550655 SOX12O15370 315 aa24.82■■□□□ 1.56
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