RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-206ENST00000548122 MED14O60244 1454 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-206ENST00000548122 PANK3Q9H999 370 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-206ENST00000548122 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-206ENST00000548122 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-206ENST00000548122 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-206ENST00000548122 PTCH1Q13635 1447 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRB-206ENST00000548122 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-206ENST00000548122 MSH5O43196 834 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRB-206ENST00000548122 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-206ENST00000548122 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-206ENST00000548122 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-206ENST00000548122 DCCP43146 1447 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-206ENST00000548122 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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PTPRB-206ENST00000548122 NPHP1O15259 732 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRB-206ENST00000548122 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 MST1RQ04912 1400 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRB-206ENST00000548122 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRB-206ENST00000548122 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 SBNO1A3KN83 1393 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 NEUROD2Q15784 382 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 FAM83GA6ND36 823 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF14Q5TI25 921 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 SPG7Q9UQ90 795 aa7.23□□□□□ -1.25
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