RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547376.5

PTPRQ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-201ENST00000547376 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 LRCH3Q96II8 777 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 ATP9BO43861 1147 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 BCAMP50895 628 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 FDX1P10109 184 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 SLC4A3P48751 1232 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 APLP1P51693 650 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 PNMA1Q8ND90 353 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 ATP6V1AP38606 617 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 STK32AQ8WU08 396 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 WNT2BQ93097 391 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRQ-201ENST00000547376 SSFA2P28290 1259 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 MTMR2Q13614 643 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 MORN1Q5T089 497 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 TCF3P15923 654 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 POTEGQ6S5H5 508 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 CCDC125Q86Z20 511 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 TSC1Q92574 1164 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 CFAP99D6REC4 459 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 POTEMA6NI47 508 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 WBP1LQ9NX94 342 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 PPP4CP60510 307 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 GIPC2Q8TF65 315 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 DRC1Q96MC2 740 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 STAC3Q96MF2 364 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 C8orf37Q96NL8 207 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 C6orf229H3BNL8 230 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NR6A1Q15406 480 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRQ-201ENST00000547376 FAM196BA6NMK8 535 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L3A6NCW0 530 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L4A6NCW7 530 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 VAMP1P23763 118 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 THAP11Q96EK4 314 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 SLAIN2Q9P270 581 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 PIK3CDO00329 1044 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 NR1H3Q13133 447 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 PRR14Q9BWN1 585 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 SERPINB4P48594 390 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 RETREG3Q86VR2 466 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 BRICD5Q6PL45 260 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L5A8MUK1 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L15C9J2P7 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L10C9JJH3 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L12C9JPN9 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L11C9JVI0 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L21D6R901 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L18D6R9N7 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L22D6RA61 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L19D6RCP7 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L20D6RJB6 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRQ-201ENST00000547376 SKIP12755 728 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms