RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530483.1

TTC17-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 2

Gene TTC17, Length 456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-211ENST00000530483 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.72□□□□□ -1.49
TTC17-211ENST00000530483 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.72□□□□□ -1.49
TTC17-211ENST00000530483 ARAP1Q96P48 1450 aa5.71□□□□□ -1.49
TTC17-211ENST00000530483 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TTC17-211ENST00000530483 MMP16P51512 607 aa5.71□□□□□ -1.5
TTC17-211ENST00000530483 RASSF7Q02833 373 aa5.71□□□□□ -1.5
TTC17-211ENST00000530483 GRIN2AQ12879 1464 aa5.71□□□□□ -1.5
TTC17-211ENST00000530483 CLASP1Q7Z460 1538 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC17-211ENST00000530483 ALDH1A1P00352 501 aa5.7□□□□□ -1.5
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TTC17-211ENST00000530483 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
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TTC17-211ENST00000530483 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa5.7□□□□□ -1.5
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TTC17-211ENST00000530483 GCGRP47871 477 aa5.67□□□□□ -1.5
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TTC17-211ENST00000530483 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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TTC17-211ENST00000530483 PBRM1Q86U86 1689 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC17-211ENST00000530483 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC17-211ENST00000530483 FOXK2Q01167 660 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC17-211ENST00000530483 SCARF1Q14162 830 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC17-211ENST00000530483 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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TTC17-211ENST00000530483 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC17-211ENST00000530483 NLRP7Q8WX94 980 aa5.63□□□□□ -1.51
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TTC17-211ENST00000530483 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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TTC17-211ENST00000530483 SHROOM2Q13796 1616 aa5.59□□□□□ -1.52
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TTC17-211ENST00000530483 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TTC17-211ENST00000530483 KCNV2Q8TDN2 545 aa5.57□□□□□ -1.52
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TTC17-211ENST00000530483 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa5.53□□□□□ -1.52
TTC17-211ENST00000530483 PHOX2BQ99453 314 aa5.53□□□□□ -1.52
TTC17-211ENST00000530483 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.53□□□□□ -1.52
TTC17-211ENST00000530483 IQGAP2Q13576 1575 aa5.53□□□□□ -1.52
TTC17-211ENST00000530483 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.53□□□□□ -1.52
TTC17-211ENST00000530483 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.52□□□□□ -1.53
TTC17-211ENST00000530483 EEA1Q15075 1411 aa5.52□□□□□ -1.53
TTC17-211ENST00000530483 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TTC17-211ENST00000530483 MARSP56192 900 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TTC17-211ENST00000530483 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
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