RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530238.5

BRMS1-207, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 5

Gene BRMS1, Length 1,817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-207ENST00000530238 BCL11AQ9H165 835 aa29.99■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 DEKP35659 375 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 FAM161AQ3B820 660 aa29.98■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.98■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 NBR1Q14596 966 aa29.97■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC27Q2M243 656 aa29.97■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 WDR63Q8IWG1 891 aa29.97■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 CPS1P31327 1500 aa29.97■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.96■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 NWD1Q149M9 1564 aa29.96■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.95■■■□□ 2.39
BRMS1-207ENST00000530238 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.94■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 PIK3R4Q99570 1358 aa29.92■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 ADGRB2O60241 1585 aa29.89■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 BCAR3O75815 825 aa29.89■■■□□ 2.38
BRMS1-207ENST00000530238 TMEM94Q12767 1356 aa29.88■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.87■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 STK26Q9P289 416 aa29.86■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.85■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.85■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.84■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 ABCC11Q96J66 1382 aa29.84■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 MTHFSP49914 203 aa29.84■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 C8orf34Q49A92 452 aa29.83■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.83■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.83■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 DLC1Q96QB1 1528 aa29.83■■■□□ 2.37
BRMS1-207ENST00000530238 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.82■■■□□ 2.36
BRMS1-207ENST00000530238 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
BRMS1-207ENST00000530238 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
BRMS1-207ENST00000530238 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
BRMS1-207ENST00000530238 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.78■■■□□ 2.36
BRMS1-207ENST00000530238 SKAP1Q86WV1 359 aa29.76■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.76■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.74■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.73■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 C14orf37Q86TY3 774 aa29.73■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.73■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 A0A1W2PP64 1363 aa29.73■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 PRAM1Q96QH2 718 aa29.73■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 PTCH1Q13635 1447 aa29.72■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 TECPR2O15040 1411 aa29.72■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 NEFMP07197 916 aa29.71■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 RGS3P49796 1198 aa29.71■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 SIRT1Q96EB6 747 aa29.71■■■□□ 2.35
BRMS1-207ENST00000530238 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 FBXO41Q8TF61 875 aa29.69■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 CABP2Q9NPB3 220 aa29.69■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 POGKQ9P215 609 aa29.69■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 COG6Q9Y2V7 657 aa29.69■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 IGHDP01880 384 aa29.68■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 NEUROD2Q15784 382 aa29.68■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 PANK1Q8TE04 598 aa29.68■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.67■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 IL16Q14005 1332 aa29.67■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.67■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 PIP4K2BP78356 416 aa29.66■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 MSH6P52701 1360 aa29.66■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.66■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
BRMS1-207ENST00000530238 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.62■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 TOM1O60784 492 aa29.62■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.62■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.62■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.62■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.62■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.59■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.59■■■□□ 2.33
BRMS1-207ENST00000530238 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.57■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 ATP7BP35670 1465 aa29.57■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 ATF3P18847 181 aa29.55■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 FYB1O15117 783 aa29.55■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 SLAIN2Q9P270 581 aa29.53■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 CDK19Q9BWU1 502 aa29.52■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms