RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513272.5

TMA16-209, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMA16, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-209ENST00000513272 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.22■■□□□ 1.95
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TMA16-209ENST00000513272 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
TMA16-209ENST00000513272 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.21■■□□□ 1.95
TMA16-209ENST00000513272 GLI3P10071 1580 aa27.21■■□□□ 1.95
TMA16-209ENST00000513272 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
TMA16-209ENST00000513272 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.21■■□□□ 1.95
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TMA16-209ENST00000513272 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.19■■□□□ 1.94
TMA16-209ENST00000513272 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.18■■□□□ 1.94
TMA16-209ENST00000513272 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.18■■□□□ 1.94
TMA16-209ENST00000513272 BTG4Q9NY30 223 aa27.18■■□□□ 1.94
TMA16-209ENST00000513272 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.16■■□□□ 1.94
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TMA16-209ENST00000513272 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.15■■□□□ 1.94
TMA16-209ENST00000513272 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.14■■□□□ 1.94
TMA16-209ENST00000513272 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.13■■□□□ 1.93
TMA16-209ENST00000513272 ABTB2Q8N961 1025 aa27.13■■□□□ 1.93
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TMA16-209ENST00000513272 CABP1Q9NZU7 370 aa27.11■■□□□ 1.93
TMA16-209ENST00000513272 KIAA0232Q92628 1395 aa27.1■■□□□ 1.93
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TMA16-209ENST00000513272 CCDC125Q86Z20 511 aa27.06■■□□□ 1.92
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TMA16-209ENST00000513272 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.04■■□□□ 1.92
TMA16-209ENST00000513272 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.04■■□□□ 1.92
TMA16-209ENST00000513272 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.04■■□□□ 1.92
TMA16-209ENST00000513272 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.03■■□□□ 1.92
TMA16-209ENST00000513272 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.03■■□□□ 1.92
TMA16-209ENST00000513272 USP6P35125 1406 aa27.02■■□□□ 1.92
TMA16-209ENST00000513272 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TMA16-209ENST00000513272 USP19O94966 1318 aa27.02■■□□□ 1.92
TMA16-209ENST00000513272 STRN4Q9NRL3 753 aa27.02■■□□□ 1.92
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TMA16-209ENST00000513272 GCP02774 474 aa26.98■■□□□ 1.91
TMA16-209ENST00000513272 NLRP6P59044 892 aa26.98■■□□□ 1.91
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TMA16-209ENST00000513272 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.96■■□□□ 1.91
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TMA16-209ENST00000513272 SLIT3O75094 1523 aa26.86■■□□□ 1.89
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TMA16-209ENST00000513272 AKAP12Q02952 1782 aa26.84■■□□□ 1.89
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TMA16-209ENST00000513272 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.83■■□□□ 1.89
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TMA16-209ENST00000513272 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TMA16-209ENST00000513272 SOX12O15370 315 aa26.82■■□□□ 1.88
TMA16-209ENST00000513272 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
TMA16-209ENST00000513272 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.81■■□□□ 1.88
TMA16-209ENST00000513272 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.8■■□□□ 1.88
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TMA16-209ENST00000513272 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.77■■□□□ 1.88
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TMA16-209ENST00000513272 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.74■■□□□ 1.87
TMA16-209ENST00000513272 NME9Q86XW9 330 aa26.74■■□□□ 1.87
TMA16-209ENST00000513272 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.74■■□□□ 1.87
TMA16-209ENST00000513272 TRIM37O94972 964 aa26.72■■□□□ 1.87
TMA16-209ENST00000513272 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TMA16-209ENST00000513272 COL18A1P39060 1754 aa26.71■■□□□ 1.87
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