RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
RASGEF1B-210ENST00000512716 RXRBP28702 533 aa33.97■■■■□ 3.03
RASGEF1B-210ENST00000512716 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
RASGEF1B-210ENST00000512716 CABP1Q9NZU7 370 aa33.96■■■■□ 3.03
RASGEF1B-210ENST00000512716 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.94■■■■□ 3.02
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.92■■■■□ 3.02
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
RASGEF1B-210ENST00000512716 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
RASGEF1B-210ENST00000512716 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.89■■■■□ 3.02
RASGEF1B-210ENST00000512716 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.88■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLIT2O94813 1529 aa33.88■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 AKAP12Q02952 1782 aa33.88■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa33.87■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATRNO75882 1429 aa33.87■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 USP6P35125 1406 aa33.87■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 NUTM2GQ5VZR2 741 aa33.86■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.85■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABTB2Q8N961 1025 aa33.85■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 USP47Q96K76 1375 aa33.84■■■■□ 3.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.82■■■■□ 3
RASGEF1B-210ENST00000512716 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
RASGEF1B-210ENST00000512716 TESK2Q96S53 571 aa33.81■■■■□ 3
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM83GA6ND36 823 aa33.79■■■■□ 3
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC24A1O60721 1099 aa33.78■■■■□ 3
RASGEF1B-210ENST00000512716 RGS12O14924 1447 aa33.78■■■■□ 3
RASGEF1B-210ENST00000512716 NLRP13Q86W25 1043 aa33.76■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMC1Q8TDI8 760 aa33.76■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 MON2Q7Z3U7 1717 aa33.76■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 SSH2Q76I76 1423 aa33.75■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 NRKQ7Z2Y5 1582 aa33.75■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 NRAPQ86VF7 1730 aa33.74■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRDM11Q9NQV5 511 aa33.74■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 PIK3C2AO00443 1686 aa33.74■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 USP19O94966 1318 aa33.73■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIAA0232Q92628 1395 aa33.72■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 BTG4Q9NY30 223 aa33.71■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 NLRP6P59044 892 aa33.7■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa33.7■■■□□ 2.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 GLI3P10071 1580 aa33.69■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.69■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMF1P82094 1093 aa33.68■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 VPS72Q15906 364 aa33.68■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 CD163L1Q9NR16 1453 aa33.68■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 TTC21AQ8NDW8 1320 aa33.67■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 CHRNA2Q15822 529 aa33.66■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 GCP02774 474 aa33.65■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 NINLQ9Y2I6 1382 aa33.64■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 TERF2IPQ9NYB0 399 aa33.64■■■□□ 2.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLIT3O75094 1523 aa33.63■■■□□ 2.97
RASGEF1B-210ENST00000512716 CPDO75976 1380 aa33.61■■■□□ 2.97
RASGEF1B-210ENST00000512716 A0A1W2PP64 1363 aa33.6■■■□□ 2.97
RASGEF1B-210ENST00000512716 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.6■■■□□ 2.97
RASGEF1B-210ENST00000512716 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
RASGEF1B-210ENST00000512716 CDCA8Q53HL2 280 aa33.57■■■□□ 2.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.56■■■□□ 2.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.55■■■□□ 2.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 STRN4Q9NRL3 753 aa33.54■■■□□ 2.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 BRWD3Q6RI45 1802 aa33.53■■■□□ 2.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 USP54Q70EL1 1684 aa33.53■■■□□ 2.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa33.53■■■□□ 2.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 KCNH5Q8NCM2 988 aa33.52■■■□□ 2.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.52■■■□□ 2.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 SOX12O15370 315 aa33.51■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 EVA1CP58658 441 aa33.51■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.51■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 NME9Q86XW9 330 aa33.51■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa33.51■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa33.51■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 USP31Q70CQ4 1352 aa33.49■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.49■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 SEPT12Q8IYM1 358 aa33.49■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZRANB1Q9UGI0 708 aa33.49■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 A0A0G2JS52 829 aa33.47■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 MYT1Q01538 1121 aa33.47■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 NFAT5O94916 1531 aa33.46■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 COL18A1P39060 1754 aa33.46■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 AATKQ6ZMQ8 1374 aa33.46■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 MYOM1P52179 1685 aa33.45■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa33.44■■■□□ 2.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 RGPD5Q99666 1765 aa33.42■■■□□ 2.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.42■■■□□ 2.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 LTN1O94822 1766 aa33.4■■■□□ 2.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 USP35Q9P2H5 1018 aa33.4■■■□□ 2.94
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