RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STAC3Q96MF2 364 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ALS2Q96Q42 1657 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WASLO00401 505 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DISP2A7MBM2 1401 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADGRB1O14514 1584 aa13.61□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM196AQ6ZSG2 479 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ITSN1Q15811 1721 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PARD3Q8TEW0 1356 aa13.58□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ATP7BP35670 1465 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM182BQ5T319 152 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIAA0232Q92628 1395 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STRN4Q9NRL3 753 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRIM37O94972 964 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EVA1CP58658 441 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PDE3BQ13370 1112 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 APBA3O96018 575 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHRNA2Q15822 529 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NBPF14Q5TI25 921 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BARGINQ6ZT62 677 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CAMKK2Q96RR4 588 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP35Q9P2H5 1018 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SSH2Q76I76 1423 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ACEP12821 1306 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABTB2Q8N961 1025 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDK19Q9BWU1 502 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CPDO75976 1380 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NLRP13Q86W25 1043 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NRKQ7Z2Y5 1582 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RREB1Q92766 1687 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP19O94966 1318 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPON1Q9HCB6 807 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 YY1P25490 414 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LMO7Q8WWI1 1683 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GCP02774 474 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUP188Q5SRE5 1749 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CRB1P82279 1406 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCNQ2O43526 872 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLSCR1O15162 318 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDB1Q16531 1140 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AATKQ6ZMQ8 1374 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NLRP6P59044 892 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP6P35125 1406 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CABP2Q9NPB3 220 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLIT3O75094 1523 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CABP1Q9NZU7 370 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PEAK1Q9H792 1746 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EVC2Q86UK5 1308 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms