RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511105.1

PTPN13-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

TSL 3

Gene PTPN13, Length 645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-208	ENST00000511105	POTEC	B2RU33	542 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	ST8SIA5	O15466	376 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	RPIA	P49247	311 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	MMP16	P51512	607 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	MYT1	Q01538	1121 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	8.05	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	TOPBP1	Q92547	1522 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	8.04	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	8.04	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	ARID3A	Q99856	593 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	ARID3C	A6NKF2	412 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	APBB1	O00213	710 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	PRR20E	P86478	221 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	PRR20C	P86479	221 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	PRR20D	P86480	221 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	PRR20B	P86481	221 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	PRR20A	P86496	221 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	MCM6	Q14566	821 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPN13-208	ENST00000511105	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	8.02	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	DACH1	Q9UI36	760 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	HRC	P23327	699 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	TRIM32	Q13049	653 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	CYP4X1	Q8N118	509 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	SOGA1	O94964	1423 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	TRAK2	O60296	914 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	DGAT1	O75907	488 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	JUND	P17535	347 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	SKOR1	P84550	965 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105		J3QL48	77 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	RETREG3	Q86VR2	466 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	PRR7	Q8TB68	274 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	IFT140	Q96RY7	1462 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	AAAS	Q9NRG9	546 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		7.96	□□□□□ -1.13
PTPN13-208	ENST00000511105	PRDM2	Q13029	1718 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	MTMR2	Q13614	643 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	7.96	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	7.96	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	CUX1	P39880	1505 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	CFAP99	D6REC4	459 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	ABCC8	Q09428	1581 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	WNT7A	O00755	349 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	SMPD1	P17405	629 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	TSC1	Q92574	1164 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	QPCT	Q16769	361 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	BAP1	Q92560	729 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	HPS1	Q92902	700 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	SPTLC1	O15269	473 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	CTH	P32929	405 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	SH3BP2	P78314	561 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	AXIN1	O15169	862 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN13-208	ENST00000511105	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN13-208	ENST00000511105	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN13-208	ENST00000511105	KCNH2	Q12809	1159 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN13-208	ENST00000511105	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	7.89	□□□□□ -1.15
PTPN13-208	ENST00000511105	MAP10	Q9P2G4	905 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN13-208	ENST00000511105	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN13-208	ENST00000511105	PTPRN	Q16849	979 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN13-208	ENST00000511105	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
PTPN13-208	ENST00000511105	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN13-208	ENST00000511105	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		7.88	□□□□□ -1.15

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