RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507075.1

ARRDC3-204, Transcript of arrestin domain containing 3, human

TSL 2

Gene ARRDC3, Length 355 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRDC3-204	ENST00000507075	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	MPND	Q8N594	471 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	DCAF5	Q96JK2	942 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	ITPKC	Q96DU7	683 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	BMP2	P12643	396 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	GUCA2A	Q02747	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	KDM4A	O75164	1064 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	CD46	P15529	392 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	PTS	Q03393	145 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	BAP1	Q92560	729 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ARRDC3-204	ENST00000507075	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	GNPAT	O15228	680 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	NR3C2	P08235	984 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	MEIOB	Q8N635	442 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF511	Q8NB15	262 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	HOXA2	O43364	376 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	GPR37	O15354	613 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADAMTS2	O95450	1211 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	6.49	□□□□□ -1.37	7e-7	■□□□□ 8.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	BTBD11	A6QL63	1104 aa		6.48	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	UPP2	O95045	317 aa		6.48	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		6.48	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	RETREG3	Q86VR2	466 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ARRDC3-204	ENST00000507075	CDC14C	A4D256	554 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	MS4A1	P11836	297 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	BAG6	P46379	1132 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	USP46	P62068	366 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	MAP3K10	Q02779	954 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	CDK15	Q96Q40	435 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	TTLL8	A6PVC2	850 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARID5B	Q14865	1188 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	SLC35F4	A4IF30	521 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	SEMA3E	O15041	775 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	FURIN	P09958	794 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	ITGA6	P23229	1130 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	SV2A	Q7L0J3	742 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	KCNH2	Q12809	1159 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	PTPRN	Q16849	979 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	GRM5	P41594	1212 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	NR5A1	Q13285	461 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	FOXJ1	Q92949	421 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	GAS6	Q14393	721 aa		6.4	□□□□□ -1.38
ARRDC3-204	ENST00000507075	SPTLC1	O15269	473 aa		6.39	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	CFAP44	Q96MT7	982 aa		6.39	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		6.39	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		6.39	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	6.38	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	6.38	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRBA1	A5PL33	1030 aa		6.37	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	C6orf229	H3BNL8	230 aa		6.37	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	ITGB7	P26010	798 aa		6.37	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		6.37	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	PODN	Q7Z5L7	613 aa		6.37	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	6.37	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.36	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	FDX1	P10109	184 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	FSHR	P23945	695 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	SPINT1	O43278	529 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ARRDC3-204	ENST00000507075	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	CBLB	Q13191	982 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRR7	Q8TB68	274 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	BCR	P11274	1271 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	CTH	P32929	405 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	IGF1R	P08069	1367 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
ARRDC3-204	ENST00000507075	AGER	Q15109	404 aa		6.29	□□□□□ -1.4

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