RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.41■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHG3A1L390 1219 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CABP2Q9NPB3 220 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VPS72Q15906 364 aa33.37■■■□□ 2.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLI3P10071 1580 aa33.36■■■□□ 2.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUTM2GQ5VZR2 741 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BTG4Q9NY30 223 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.31■■■□□ 2.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EVC2Q86UK5 1308 aa33.3■■■□□ 2.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRDM11Q9NQV5 511 aa33.3■■■□□ 2.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABTB2Q8N961 1025 aa33.29■■■□□ 2.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TONSLQ96HA7 1378 aa33.29■■■□□ 2.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEPT12Q8IYM1 358 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CABP1Q9NZU7 370 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NRAPQ86VF7 1730 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA0232Q92628 1395 aa33.23■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0G2JS52 829 aa33.22■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYT1Q01538 1121 aa33.22■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRWD3Q6RI45 1802 aa33.21■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHRNA2Q15822 529 aa33.21■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CARD11Q9BXL7 1154 aa33.21■■■□□ 2.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLRP13Q86W25 1043 aa33.19■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC125Q86Z20 511 aa33.18■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP6P35125 1406 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT27Q7Z3Y8 459 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STRN4Q9NRL3 753 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EP400Q96L91 3159 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP19O94966 1318 aa33.12■■■□□ 2.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCP02774 474 aa33.11■■■□□ 2.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EVA1CP58658 441 aa33.11■■■□□ 2.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLRP6P59044 892 aa33.11■■■□□ 2.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NRKQ7Z2Y5 1582 aa33.1■■■□□ 2.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPDO75976 1380 aa33.06■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa33.05■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa33.05■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.04■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSH2Q76I76 1423 aa33.03■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP35Q9P2H5 1018 aa33.02■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa33.02■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKAP12Q02952 1782 aa33.01■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa33.01■■■□□ 2.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIK3C2AO00443 1686 aa32.98■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMC1Q8TDI8 760 aa32.97■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMO7Q8WWI1 1683 aa32.97■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTC21AQ8NDW8 1320 aa32.97■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa32.96■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLIT3O75094 1523 aa32.96■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM182BQ5T319 152 aa32.95■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFB132Q7Z7B7 95 aa32.95■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.95■■■□□ 2.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SOX12O15370 315 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BARGINQ6ZT62 677 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCP11L2Q8N4U5 519 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNH5Q8NCM2 988 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.9■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MON2Q7Z3U7 1717 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDE3BQ13370 1112 aa32.86■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BAG6P46379 1132 aa32.85■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TESK2Q96S53 571 aa32.85■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TERF2IPQ9NYB0 399 aa32.85■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC24A1O60721 1099 aa32.84■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF25Q86VW2 580 aa32.84■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.84■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRB1P82279 1406 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM196AQ6ZSG2 479 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AXIN2Q9Y2T1 843 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL18A1P39060 1754 aa32.81■■■□□ 2.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NME9Q86XW9 330 aa32.81■■■□□ 2.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGPD1P0DJD0 1748 aa32.8■■■□□ 2.84
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