RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	BAG6	P46379	1132 aa		34.05	■■■■□ 3.04
SIMC1-208	ENST00000495423	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	34.04	■■■■□ 3.04
SIMC1-208	ENST00000495423	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	34.04	■■■■□ 3.04
SIMC1-208	ENST00000495423		A0A0G2JS52	829 aa		34.03	■■■■□ 3.04
SIMC1-208	ENST00000495423	MYT1	Q01538	1121 aa		34.03	■■■■□ 3.04
SIMC1-208	ENST00000495423	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
SIMC1-208	ENST00000495423	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		34.01	■■■■□ 3.04
SIMC1-208	ENST00000495423	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	34.01	■■■■□ 3.03
SIMC1-208	ENST00000495423	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		34.01	■■■■□ 3.03
SIMC1-208	ENST00000495423	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		34.01	■■■■□ 3.03
SIMC1-208	ENST00000495423	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.99	■■■■□ 3.03
SIMC1-208	ENST00000495423	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.96	■■■■□ 3.03
SIMC1-208	ENST00000495423	ATP7B	P35670	1465 aa		33.95	■■■■□ 3.03
SIMC1-208	ENST00000495423	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	33.95	■■■■□ 3.03
SIMC1-208	ENST00000495423	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.95	■■■■□ 3.03
SIMC1-208	ENST00000495423	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.93	■■■■□ 3.02
SIMC1-208	ENST00000495423	HRC	P23327	699 aa		33.93	■■■■□ 3.02
SIMC1-208	ENST00000495423	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.93	■■■■□ 3.02
SIMC1-208	ENST00000495423	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.92	■■■■□ 3.02
SIMC1-208	ENST00000495423	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.91	■■■■□ 3.02
SIMC1-208	ENST00000495423	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.91	■■■■□ 3.02
SIMC1-208	ENST00000495423	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
SIMC1-208	ENST00000495423	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.88	■■■■□ 3.01
SIMC1-208	ENST00000495423	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.86	■■■■□ 3.01
SIMC1-208	ENST00000495423	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.86	■■■■□ 3.01
SIMC1-208	ENST00000495423	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.85	■■■■□ 3.01
SIMC1-208	ENST00000495423	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.83	■■■■□ 3.01
SIMC1-208	ENST00000495423	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
SIMC1-208	ENST00000495423	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		33.79	■■■■□ 3
SIMC1-208	ENST00000495423	RREB1	Q92766	1687 aa		33.78	■■■■□ 3
SIMC1-208	ENST00000495423	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.78	■■■■□ 3
SIMC1-208	ENST00000495423	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.77	■■■■□ 3
SIMC1-208	ENST00000495423	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.77	■■■■□ 3
SIMC1-208	ENST00000495423	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.74	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.74	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	CDK19	Q9BWU1	502 aa		33.74	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.74	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	SSH2	Q76I76	1423 aa		33.73	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		33.72	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	TRIM37	O94972	964 aa		33.72	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.72	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	ACE	P12821	1306 aa		33.72	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		33.7	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.7	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.7	■■■□□ 2.99
SIMC1-208	ENST00000495423	CPD	O75976	1380 aa		33.69	■■■□□ 2.98
SIMC1-208	ENST00000495423	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
SIMC1-208	ENST00000495423	USP19	O94966	1318 aa		33.66	■■■□□ 2.98
SIMC1-208	ENST00000495423	APBA3	O96018	575 aa		33.64	■■■□□ 2.98
SIMC1-208	ENST00000495423	EVA1C	P58658	441 aa		33.64	■■■□□ 2.98
SIMC1-208	ENST00000495423	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.64	■■■□□ 2.98
SIMC1-208	ENST00000495423	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SIMC1-208	ENST00000495423	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.62	■■■□□ 2.97
SIMC1-208	ENST00000495423	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
SIMC1-208	ENST00000495423	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.6	■■■□□ 2.97
SIMC1-208	ENST00000495423	SBF2	Q86WG5	1849 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SIMC1-208	ENST00000495423	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
SIMC1-208	ENST00000495423	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.97
SIMC1-208	ENST00000495423	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	NLRP13	Q86W25	1043 aa		33.55	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	GC	P02774	474 aa		33.53	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SIMC1-208	ENST00000495423	SLIT3	O75094	1523 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	CRB1	P82279	1406 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	COL18A1	P39060	1754 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	NBPF14	Q5TI25	921 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	PIK3C2A	O00443	1686 aa		33.45	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	USP6	P35125	1406 aa		33.45	■■■□□ 2.95
SIMC1-208	ENST00000495423	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.45	■■■□□ 2.94
SIMC1-208	ENST00000495423	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.45	■■■□□ 2.94
SIMC1-208	ENST00000495423	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.45	■■■□□ 2.94
SIMC1-208	ENST00000495423	CABP2	Q9NPB3	220 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SIMC1-208	ENST00000495423	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SIMC1-208	ENST00000495423	AKAP12	Q02952	1782 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SIMC1-208	ENST00000495423	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SIMC1-208	ENST00000495423	NLRP6	P59044	892 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SIMC1-208	ENST00000495423	CABP1	Q9NZU7	370 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SIMC1-208	ENST00000495423	CASZ1	Q86V15	1759 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SIMC1-208	ENST00000495423	SPON1	Q9HCB6	807 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SIMC1-208	ENST00000495423	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SIMC1-208	ENST00000495423	PLSCR1	O15162	318 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SIMC1-208	ENST00000495423	KCNQ2	O43526	872 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SIMC1-208	ENST00000495423	DDB1	Q16531	1140 aa		33.33	■■■□□ 2.93

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