RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495174.5

SH3BP1-208, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 947 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-208ENST00000495174 AKAP12Q02952 1782 aa19.41■□□□□ 0.7
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SH3BP1-208ENST00000495174 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1-208ENST00000495174 CABP1Q9NZU7 370 aa19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1-208ENST00000495174 NWD2Q9ULI1 1742 aa19.38■□□□□ 0.69
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SH3BP1-208ENST00000495174 TTC21AQ8NDW8 1320 aa19.27■□□□□ 0.68
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SH3BP1-208ENST00000495174 CD163L1Q9NR16 1453 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-208ENST00000495174 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-208ENST00000495174 USP54Q70EL1 1684 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-208ENST00000495174 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-208ENST00000495174 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.25■□□□□ 0.67
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SH3BP1-208ENST00000495174 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
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SH3BP1-208ENST00000495174 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1-208ENST00000495174 PRDM11Q9NQV5 511 aa19.23■□□□□ 0.67
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SH3BP1-208ENST00000495174 GLI3P10071 1580 aa19.21■□□□□ 0.67
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SH3BP1-208ENST00000495174 A0A1W2PP64 1363 aa19.2■□□□□ 0.66
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SH3BP1-208ENST00000495174 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
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SH3BP1-208ENST00000495174 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.18■□□□□ 0.66
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SH3BP1-208ENST00000495174 COL18A1P39060 1754 aa19.14■□□□□ 0.66
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SH3BP1-208ENST00000495174 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.14■□□□□ 0.65
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SH3BP1-208ENST00000495174 LTN1O94822 1766 aa19.11■□□□□ 0.65
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SH3BP1-208ENST00000495174 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-208ENST00000495174 RGPD5Q99666 1765 aa19.11■□□□□ 0.65
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SH3BP1-208ENST00000495174 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
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SH3BP1-208ENST00000495174 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.09■□□□□ 0.65
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SH3BP1-208ENST00000495174 STRN4Q9NRL3 753 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-208ENST00000495174 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-208ENST00000495174 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-208ENST00000495174 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.07■□□□□ 0.64
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SH3BP1-208ENST00000495174 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-208ENST00000495174 COG3Q96JB2 828 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-208ENST00000495174 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
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