RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.95■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 BAG6P46379 1132 aa24.92■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 FAM182BQ5T319 152 aa24.91■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.9■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.88■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.88■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.88■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 STAC3Q96MF2 364 aa24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 ITSN1Q15811 1721 aa24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.84■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 LRP5O75197 1615 aa24.83■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 CHRNA2Q15822 529 aa24.83■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 ATP7BP35670 1465 aa24.83■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.82■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA0232Q92628 1395 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 HRCP23327 699 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 CDK19Q9BWU1 502 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 STRN4Q9NRL3 753 aa24.8■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.79■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 ACEP12821 1306 aa24.76■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.75■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 USP35Q9P2H5 1018 aa24.75■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 TRIM37O94972 964 aa24.74■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 DISP2A7MBM2 1401 aa24.73■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 EVA1CP58658 441 aa24.73■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.73■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.72■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.72■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.7■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 ABTB2Q8N961 1025 aa24.7■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.69■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.68■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.68■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 SSH2Q76I76 1423 aa24.68■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.67■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 APBA3O96018 575 aa24.67■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 PDE3BQ13370 1112 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 BARGINQ6ZT62 677 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.63■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 USP19O94966 1318 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 GCP02774 474 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 NLRP13Q86W25 1043 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 CPDO75976 1380 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.61■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 CABP2Q9NPB3 220 aa24.61■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.58■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 RREB1Q92766 1687 aa24.57■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.57■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.55■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.54■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 CABP1Q9NZU7 370 aa24.54■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 NLRP6P59044 892 aa24.53■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF14Q5TI25 921 aa24.53■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 USP6P35125 1406 aa24.51■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 CRB1P82279 1406 aa24.5■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 SBF2Q86WG5 1849 aa24.47■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.47■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.46■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 SLIT3O75094 1523 aa24.45■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 COL18A1P39060 1754 aa24.45■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 PEAK1Q9H792 1746 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 PIK3C2AO00443 1686 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 DDB1Q16531 1140 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 LRRC37A3O60309 1634 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 EVC2Q86UK5 1308 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD5Q99666 1765 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 SPON1Q9HCB6 807 aa24.42■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 SOX12O15370 315 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms