RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.42□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 NR1I2O75469 434 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 SOX11P35716 441 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 RETREG2Q8NC44 543 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 PNMA1Q8ND90 353 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 ALG2Q9H553 416 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.41□□□□□ -1.22
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ITGB3BP-211ENST00000478538 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB3BP-211ENST00000478538 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.4□□□□□ -1.22
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ITGB3BP-211ENST00000478538 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.37□□□□□ -1.23
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ITGB3BP-211ENST00000478538 FBXO45P0C2W1 286 aa7.36□□□□□ -1.23
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ITGB3BP-211ENST00000478538 MAP10Q9P2G4 905 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ITGB3BP-211ENST00000478538 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ITGB3BP-211ENST00000478538 POTECB2RU33 542 aa7.35□□□□□ -1.23
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ITGB3BP-211ENST00000478538 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
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ITGB3BP-211ENST00000478538 ZBBXA8MT70 800 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGB3BP-211ENST00000478538 SEMA3FQ13275 785 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF516Q92618 1163 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPSB2Q99619 263 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.33□□□□□ -1.24
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ITGB3BP-211ENST00000478538 COPS2P61201 443 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 IL21Q9HBE4 155 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 USTQ9Y2C2 406 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 TLL1O43897 1013 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 CTHP32929 405 aa7.31□□□□□ -1.24
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ITGB3BP-211ENST00000478538 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.31□□□□□ -1.24
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ITGB3BP-211ENST00000478538 ADH1BP00325 375 aa7.3□□□□□ -1.24
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ITGB3BP-211ENST00000478538 KCNH2Q12809 1159 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.3□□□□□ -1.24
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ITGB3BP-211ENST00000478538 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 PIK3CDO00329 1044 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 ATG7O95352 703 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 MYT1Q01538 1121 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB3BP-211ENST00000478538 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF592Q92610 1267 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTK2Q05397 1052 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.25□□□□□ -1.25
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ITGB3BP-211ENST00000478538 USP17L3A6NCW0 530 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 USP17L4A6NCW7 530 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 USP17L5A8MUK1 530 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 PKDCCQ504Y2 493 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 TREML4Q6UXN2 200 aa7.24□□□□□ -1.25
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ITGB3BP-211ENST00000478538 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 BRD1O95696 1058 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ITGB3BP-211ENST00000478538 SKIP12755 728 aa7.22□□□□□ -1.25
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