RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-208ENST00000468570 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.54□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 RETREG3Q86VR2 466 aa6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 P3H3Q8IVL6 736 aa6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 ZNF511Q8NB15 262 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 ITPKCQ96DU7 683 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 CDK15Q96Q40 435 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.51□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.51□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.51□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 ADAM23O75077 832 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 ITGB2P05107 769 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 SLURP2P0DP57 97 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 NR3C2P08235 984 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 MS4A1P11836 297 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 GRM5P41594 1212 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 KCNH2Q12809 1159 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 FOXK2Q01167 660 aa6.48□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 PTPRNQ16849 979 aa6.48□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 KANK3Q6NY19 840 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-208ENST00000468570 C6orf229H3BNL8 230 aa6.46□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 SVOPQ8N4V2 548 aa6.46□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 BMP2P12643 396 aa6.45□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 PTSQ03393 145 aa6.45□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.45□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.45□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 MEIOBQ8N635 442 aa6.45□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 FOXJ1Q92949 421 aa6.45□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 NDUFV2P19404 249 aa6.44□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.44□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 IRF6O14896 467 aa6.43□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 FDX1P10109 184 aa6.43□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 MAP2K5Q13163 448 aa6.43□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 NR5A1Q13285 461 aa6.43□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 ARID5BQ14865 1188 aa6.43□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.43□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 CCDC102AQ96A19 550 aa6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 SLC35F4A4IF30 521 aa6.41□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 PROCP04070 461 aa6.41□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.41□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.41□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.41□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.41□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 MSTNO14793 375 aa6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 DESI1Q6ICB0 168 aa6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 PRR7Q8TB68 274 aa6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-208ENST00000468570 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-208ENST00000468570 TTLL8A6PVC2 850 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-208ENST00000468570 SPTLC1O15269 473 aa6.39□□□□□ -1.39
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SGIP1-208ENST00000468570 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.38□□□□□ -1.39
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SGIP1-208ENST00000468570 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SGIP1-208ENST00000468570 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.38□□□□□ -1.39
SGIP1-208ENST00000468570 MAP10Q9P2G4 905 aa6.38□□□□□ -1.39
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SGIP1-208ENST00000468570 LYPD8Q6UX82 237 aa6.37□□□□□ -1.39
SGIP1-208ENST00000468570 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.37□□□□□ -1.39
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SGIP1-208ENST00000468570 ADAMTS2O95450 1211 aa6.36□□□□□ -1.39
SGIP1-208ENST00000468570 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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SGIP1-208ENST00000468570 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.36□□□□□ -1.39
SGIP1-208ENST00000468570 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGIP1-208ENST00000468570 SV2AQ7L0J3 742 aa6.34□□□□□ -1.39
SGIP1-208ENST00000468570 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 SPINT1O43278 529 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 GAS6Q14393 721 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 Q6ZVU0 165 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 CFAP99D6REC4 459 aa6.32□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 CLCN1P35523 988 aa6.32□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 MTMR2Q13614 643 aa6.32□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 AGERQ15109 404 aa6.32□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 CDC14CA4D256 554 aa6.31□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.31□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 FSHRP23945 695 aa6.31□□□□□ -1.4
SGIP1-208ENST00000468570 CBLBQ13191 982 aa6.31□□□□□ -1.4
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