RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.82□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 OATP04181 439 aa6.82□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 PTSQ03393 145 aa6.82□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 BMP2P12643 396 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 ITGB7P26010 798 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 SH3BP2P78314 561 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 PODNQ7Z5L7 613 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 MPNDQ8N594 471 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 KRBA1A5PL33 1030 aa6.78□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.78□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.78□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.78□□□□□ -1.32
SHQ1-204ENST00000468347 UPP2O95045 317 aa6.77□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 SV2AQ7L0J3 742 aa6.77□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.77□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 CDC14CA4D256 554 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 ITPKCQ96DU7 683 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 ITGA6P23229 1130 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 JUNDP17535 347 aa6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 MEIOBQ8N635 442 aa6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 SLC35F4A4IF30 521 aa6.72□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 SULF1Q8IWU6 871 aa6.72□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.72□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.72□□□□□ -1.33
SHQ1-204ENST00000468347 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 TTLL8A6PVC2 850 aa6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 COBLO75128 1261 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 NUTM2FA1L443 756 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 GAS6Q14393 721 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 LINC01559Q495D7 138 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 FCHSD2O94868 740 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 BCRP11274 1271 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 NR3C2P08235 984 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 BAP1Q92560 729 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 CDK15Q96Q40 435 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF511Q8NB15 262 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-204ENST00000468347 COL8A1P27658 744 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 NR5A1Q13285 461 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 ARTNQ5T4W7 220 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 NLRP7Q8WX94 980 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 SPTLC1O15269 473 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 NBPF11Q86T75 865 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 HLA-CQ95604 372 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 WDR70Q9NW82 654 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 ARID5BQ14865 1188 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 MBIPQ9NS73 344 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 IGF1RP08069 1367 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 ACDQ96AP0 544 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-204ENST00000468347 GRM5P41594 1212 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 KDM4AO75164 1064 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 CD163Q86VB7 1156 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 MS4A1P11836 297 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 DOC2BQ14184 412 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 RETREG3Q86VR2 466 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 SPINT1O43278 529 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 HIC1Q14526 733 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 CD46P15529 392 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 USP46P62068 366 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 KCNH2Q12809 1159 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 PTPRNQ16849 979 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 OIP5O43482 229 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 GRIN2CQ14957 1233 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-204ENST00000468347 HOXA2O43364 376 aa6.52□□□□□ -1.37
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