RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	VPS72	Q15906	364 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGL3	Q3MIN7	710 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SBNO1	A3KN83	1393 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLIT2	O94813	1529 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BAG6	P46379	1132 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STAC3	Q96MF2	364 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUTM2F	A1L443	756 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POGK	Q9P215	609 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PIK3C2G	O75747	1445 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A0G2JS52	829 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USP32	Q8NFA0	1604 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HAX1	O00165	279 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EP400	Q96L91	3159 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRAM1	Q96QH2	718 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GLI3	P10071	1580 aa		12.4	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		12.4	□□□□□ -0.42
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IFT172	Q9UG01	1749 aa		12.4	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DLC1	Q96QB1	1528 aa		12.39	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		12.39	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM83G	A6ND36	823 aa		12.38	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		12.38	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		12.38	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BTG4	Q9NY30	223 aa		12.38	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANP32C	O43423	234 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRP5	O75197	1615 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	12.36	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBPF14	Q5TI25	921 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DISP2	A7MBM2	1401 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADGRB2	O60241	1585 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLEKHG5	O94827	1062 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EVA1C	P58658	441 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PDE3B	Q13370	1112 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATP7B	P35670	1465 aa		12.3	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCA3	Q99758	1704 aa		12.29	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	12.29	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		12.29	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		12.29	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		12.29	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		12.29	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	APBA3	O96018	575 aa		12.28	□□□□□ -0.44

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