RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHG5O94827 1062 aa20.81■□□□□ 0.92
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SH3BP1-205ENST00000466097 SLC24A1O60721 1099 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 USP21Q9UK80 565 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 USP47Q96K76 1375 aa20.78■□□□□ 0.92
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SH3BP1-205ENST00000466097 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.64■□□□□ 0.89
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SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1W2PP64 1363 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-205ENST00000466097 CPDO75976 1380 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-205ENST00000466097 GCP02774 474 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-205ENST00000466097 USP54Q70EL1 1684 aa20.61■□□□□ 0.89
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SH3BP1-205ENST00000466097 CHRNA2Q15822 529 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-205ENST00000466097 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP1-205ENST00000466097 MYOM1P52179 1685 aa20.56■□□□□ 0.88
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SH3BP1-205ENST00000466097 USP31Q70CQ4 1352 aa20.55■□□□□ 0.88
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SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A0G2JS52 829 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 MYT1Q01538 1121 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCC6O95255 1503 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.48■□□□□ 0.87
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