RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 APAF1O14727 1248 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 FYB1O15117 783 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 RUNDC1Q96C34 613 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CABP1Q9NZU7 370 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 AKAP12Q02952 1782 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM94Q12767 1356 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 E9PSI1 815 aa24.49■■□□□ 1.51
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SH3BP2-202ENST00000435136 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ITSN1Q15811 1721 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PIK3R4Q99570 1358 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
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SH3BP2-202ENST00000435136 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 NWD1Q149M9 1564 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.45■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PTCH1Q13635 1447 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-202ENST00000435136 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.43■■□□□ 1.5
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SH3BP2-202ENST00000435136 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
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SH3BP2-202ENST00000435136 WWC1Q8IX03 1113 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR63Q8IWG1 891 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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SH3BP2-202ENST00000435136 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 C14orf37Q86TY3 774 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.33■■□□□ 1.48
SH3BP2-202ENST00000435136 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
SH3BP2-202ENST00000435136 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-202ENST00000435136 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.32■■□□□ 1.48
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SH3BP2-202ENST00000435136 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-202ENST00000435136 MSH6P52701 1360 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-202ENST00000435136 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
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SH3BP2-202ENST00000435136 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-202ENST00000435136 POLKQ9UBT6 870 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-202ENST00000435136 SLAIN2Q9P270 581 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-202ENST00000435136 PLIN1O60240 522 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 COG3Q96JB2 828 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CRBNQ96SW2 442 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 FCHSD2O94868 740 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 USP6P35125 1406 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 IL16Q14005 1332 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 ATF3P18847 181 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 HSPA1LP34931 641 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 NME9Q86XW9 330 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
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SH3BP2-202ENST00000435136 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 SSH2Q76I76 1423 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 NEUROD2Q15784 382 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.21■■□□□ 1.47
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SH3BP2-202ENST00000435136 PDE3AQ14432 1141 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 USP31Q70CQ4 1352 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 IL13P35225 146 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 NEFMP07197 916 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 USP54Q70EL1 1684 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 BCAR3O75815 825 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-202ENST00000435136 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-202ENST00000435136 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-202ENST00000435136 AAMPQ13685 434 aa24.13■■□□□ 1.45
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