RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.19■■□□□ 1.14
SPC24-201ENST00000423327 ACEP12821 1306 aa22.19■■□□□ 1.14
SPC24-201ENST00000423327 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.18■■□□□ 1.14
SPC24-201ENST00000423327 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPC24-201ENST00000423327 GLI3P10071 1580 aa22.18■■□□□ 1.14
SPC24-201ENST00000423327 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.18■■□□□ 1.14
SPC24-201ENST00000423327 NRAPQ86VF7 1730 aa22.17■■□□□ 1.14
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SPC24-201ENST00000423327 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPC24-201ENST00000423327 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPC24-201ENST00000423327 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.14■■□□□ 1.13
SPC24-201ENST00000423327 FAM83GA6ND36 823 aa22.13■■□□□ 1.13
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SPC24-201ENST00000423327 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.11■■□□□ 1.13
SPC24-201ENST00000423327 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.11■■□□□ 1.13
SPC24-201ENST00000423327 EVC2Q86UK5 1308 aa22.1■■□□□ 1.13
SPC24-201ENST00000423327 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.1■■□□□ 1.13
SPC24-201ENST00000423327 CABP1Q9NZU7 370 aa22.09■■□□□ 1.13
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SPC24-201ENST00000423327 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.08■■□□□ 1.13
SPC24-201ENST00000423327 AKAP12Q02952 1782 aa22.07■■□□□ 1.12
SPC24-201ENST00000423327 SSH2Q76I76 1423 aa22.07■■□□□ 1.12
SPC24-201ENST00000423327 VPS72Q15906 364 aa22.06■■□□□ 1.12
SPC24-201ENST00000423327 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.06■■□□□ 1.12
SPC24-201ENST00000423327 USP19O94966 1318 aa22.06■■□□□ 1.12
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SPC24-201ENST00000423327 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.01■■□□□ 1.11
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SPC24-201ENST00000423327 SLIT3O75094 1523 aa22.01■■□□□ 1.11
SPC24-201ENST00000423327 MON2Q7Z3U7 1717 aa22■■□□□ 1.11
SPC24-201ENST00000423327 PRDM11Q9NQV5 511 aa22■■□□□ 1.11
SPC24-201ENST00000423327 CD163L1Q9NR16 1453 aa22■■□□□ 1.11
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SPC24-201ENST00000423327 CHRNA2Q15822 529 aa21.99■■□□□ 1.11
SPC24-201ENST00000423327 TESK2Q96S53 571 aa21.97■■□□□ 1.11
SPC24-201ENST00000423327 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.97■■□□□ 1.11
SPC24-201ENST00000423327 CPDO75976 1380 aa21.97■■□□□ 1.11
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SPC24-201ENST00000423327 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.95■■□□□ 1.1
SPC24-201ENST00000423327 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.95■■□□□ 1.1
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SPC24-201ENST00000423327 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.94■■□□□ 1.1
SPC24-201ENST00000423327 GCP02774 474 aa21.94■■□□□ 1.1
SPC24-201ENST00000423327 NLRP13Q86W25 1043 aa21.94■■□□□ 1.1
SPC24-201ENST00000423327 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.94■■□□□ 1.1
SPC24-201ENST00000423327 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.94■■□□□ 1.1
SPC24-201ENST00000423327 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.94■■□□□ 1.1
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SPC24-201ENST00000423327 NFAT5O94916 1531 aa21.89■■□□□ 1.09
SPC24-201ENST00000423327 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SPC24-201ENST00000423327 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.88■■□□□ 1.09
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SPC24-201ENST00000423327 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.88■■□□□ 1.09
SPC24-201ENST00000423327 STRN4Q9NRL3 753 aa21.88■■□□□ 1.09
SPC24-201ENST00000423327 A0A1W2PP64 1363 aa21.87■■□□□ 1.09
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SPC24-201ENST00000423327 TMC1Q8TDI8 760 aa21.85■■□□□ 1.09
SPC24-201ENST00000423327 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.85■■□□□ 1.09
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SPC24-201ENST00000423327 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.84■■□□□ 1.09
SPC24-201ENST00000423327 USP31Q70CQ4 1352 aa21.84■■□□□ 1.09
SPC24-201ENST00000423327 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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SPC24-201ENST00000423327 MYT1Q01538 1121 aa21.81■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.8■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.8■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.8■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.8■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.8■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.8■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 SOX12O15370 315 aa21.79■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 USP35Q9P2H5 1018 aa21.79■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 MYOM1P52179 1685 aa21.79■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 EVA1CP58658 441 aa21.78■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 FAM182BQ5T319 152 aa21.78■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 CRB1P82279 1406 aa21.78■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.78■■□□□ 1.08
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