RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM132EQ6IEE7 984 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 AGLP35573 1532 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ERBB4Q15303 1308 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC24A1O60721 1099 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS3P49796 1198 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC4O15439 1325 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 A2ML1A8K2U0 1454 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 NRKQ7Z2Y5 1582 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ALKQ9UM73 1620 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 CPS1P31327 1500 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 PREX1Q8TCU6 1659 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO5BQ9ULV0 1848 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 IL17RAQ96F46 866 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RGPD1P0DJD0 1748 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP74Q9C0B2 1584 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPOP42166 694 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 DDRGK1Q96HY6 314 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 AATKQ6ZMQ8 1374 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 PANK2Q9BZ23 570 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RSPH6AQ9H0K4 717 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 POLKQ9UBT6 870 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 C3P01024 1663 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAK1Q9UPV9 953 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP7BP35670 1465 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 VAMP4O75379 141 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL2L13Q9BXK5 485 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 MCM4P33991 863 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX21Q969T3 373 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP45Q92619 1136 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 NUCB1Q02818 461 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM43AQ8N2R8 423 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 NWD1Q149M9 1564 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPYL6Q8N831 410 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ATAD2Q6PL18 1390 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 NALCNQ8IZF0 1738 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RAPGEF3O95398 923 aa4.65□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.65□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR36Q9H6K5 1346 aa4.65□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.65□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa4.65□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 IL13P35225 146 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC52A1Q9NWF4 448 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 OVOS2Q6IE36 1432 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 KDRP35968 1356 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0232Q92628 1395 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 ERICH6Q7L0X2 663 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 MON2Q7Z3U7 1717 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 MORC1Q86VD1 984 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH1L2Q3SY69 923 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF428Q96B54 188 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 METP08581 1390 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CABP2Q9NPB3 220 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 FBLN1P23142 703 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCN1P35523 988 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CRB1P82279 1406 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 PEAK1Q9H792 1746 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB3GAP1Q15042 981 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC37A3O60309 1634 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 FCHSD2O94868 740 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 EVC2Q86UK5 1308 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 USP31Q70CQ4 1352 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 VGFO15240 615 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 DLG5Q8TDM6 1919 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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