RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRCH3Q96II8 777 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L3A6NCW0 530 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L4A6NCW7 530 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 PIK3CDO00329 1044 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTPRNQ16849 979 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF592Q92610 1267 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 SKIP12755 728 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 JUNDP17535 347 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L5A8MUK1 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF428Q96B54 188 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 THAP11Q96EK4 314 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 E9PSI1 815 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 NR1I2O75469 434 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTK2Q05397 1052 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 STK32AQ8WU08 396 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAP10Q9P2G4 905 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L15C9J2P7 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L10C9JJH3 530 aa7.29□□□□□ -1.24
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RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L12C9JPN9 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L11C9JVI0 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L21D6R901 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L18D6R9N7 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L22D6RA61 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L19D6RCP7 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L20D6RJB6 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 SSFA2P28290 1259 aa7.29□□□□□ -1.24
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RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L24Q0WX57 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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RNU6-272P-201ENST00000411028 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.28□□□□□ -1.24
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RNU6-272P-201ENST00000411028 EMP3P54852 163 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTK7Q13308 1070 aa7.28□□□□□ -1.24
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RNU6-272P-201ENST00000411028 MSS51Q4VC12 460 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.28□□□□□ -1.24
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RNU6-272P-201ENST00000411028 APLP1P51693 650 aa7.27□□□□□ -1.25
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RNU6-272P-201ENST00000411028 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNH2Q12809 1159 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 NCOA4Q13772 614 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 NBPF14Q5TI25 921 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNF135Q8IUD6 432 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 ST18O60284 1047 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 MMP16P51512 607 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 ERCC3P19447 782 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLAIN2Q9P270 581 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM205CA6NFA0 338 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.23□□□□□ -1.25
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