RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 BARGINQ6ZT62 677 aa11.39□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 ZMYND10O75800 440 aa11.38□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 FBXO41Q8TF61 875 aa11.38□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 ADGRL1O94910 1474 aa11.38□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 PBRM1Q86U86 1689 aa11.37□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.37□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 DIP2BQ9P265 1576 aa11.37□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 AVPP01185 164 aa11.36□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 GUCA2AQ02747 115 aa11.35□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 TRIM32Q13049 653 aa11.35□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 AMHR2Q16671 573 aa11.35□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 AAASQ9NRG9 546 aa11.35□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 SHROOM2Q13796 1616 aa11.35□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 TSPOAP1O95153 1857 aa11.34□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 WNT7AO00755 349 aa11.34□□□□□ -0.59
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 CUX1P39880 1505 aa11.32□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.32□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 ST8SIA5O15466 376 aa11.32□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 CYP4X1Q8N118 509 aa11.32□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 NUP160Q12769 1436 aa11.32□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 GRIN2AQ12879 1464 aa11.32□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 JUNDP17535 347 aa11.31□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 RETREG3Q86VR2 466 aa11.31□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.31□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.3□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.3□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 MAPKBP1O60336 1514 aa11.3□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.28□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.28□□□□□ -0.6
CCL20-202ENST00000409189 FDX1P10109 184 aa11.27□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.27□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 ILDR2Q71H61 639 aa11.27□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 SMPD1P17405 629 aa11.25□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 WNT7BP56706 349 aa11.25□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 SKOR1P84550 965 aa11.25□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.25□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS12P58397 1594 aa11.24□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.24□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.23□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 DACH1Q9UI36 760 aa11.23□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.22□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 AXIN1O15169 862 aa11.22□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.22□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.22□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 SOCS7O14512 581 aa11.21□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.21□□□□□ -0.61
CCL20-202ENST00000409189 NDUFV2P19404 249 aa11.2□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 GJA5P36382 358 aa11.2□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 C6orf229H3BNL8 230 aa11.19□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 J3QL48 77 aa11.19□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 TRIM66O15016 1216 aa11.19□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.19□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 MS4A1P11836 297 aa11.18□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 PTPRNQ16849 979 aa11.18□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.17□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 DESI1Q6ICB0 168 aa11.17□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.16□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 SIAH2O43255 324 aa11.15□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 MTMR2Q13614 643 aa11.15□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 AK7Q96M32 723 aa11.15□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.15□□□□□ -0.62
CCL20-202ENST00000409189 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.14□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 PRR7Q8TB68 274 aa11.14□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.14□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.14□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 HPS1Q92902 700 aa11.13□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 SPTLC1O15269 473 aa11.12□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 SH3BP2P78314 561 aa11.11□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.11□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.11□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 KCNH2Q12809 1159 aa11.1□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.1□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.09□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.09□□□□□ -0.63
CCL20-202ENST00000409189 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.08□□□□□ -0.64
CCL20-202ENST00000409189 GLI2P10070 1586 aa11.07□□□□□ -0.64
CCL20-202ENST00000409189 ALDH1A1P00352 501 aa11.07□□□□□ -0.64
CCL20-202ENST00000409189 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CCL20-202ENST00000409189 LYPD8Q6UX82 237 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms