RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.16■■□□□ 1.94
ODC1-202ENST00000405333 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.16■■□□□ 1.94
ODC1-202ENST00000405333 SSH2Q76I76 1423 aa27.15■■□□□ 1.94
ODC1-202ENST00000405333 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.15■■□□□ 1.94
ODC1-202ENST00000405333 FBLN1P23142 703 aa27.14■■□□□ 1.94
ODC1-202ENST00000405333 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.14■■□□□ 1.93
ODC1-202ENST00000405333 ATF3P18847 181 aa27.12■■□□□ 1.93
ODC1-202ENST00000405333 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.12■■□□□ 1.93
ODC1-202ENST00000405333 MST1RQ04912 1400 aa27.11■■□□□ 1.93
ODC1-202ENST00000405333 MTHFSP49914 203 aa27.1■■□□□ 1.93
ODC1-202ENST00000405333 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.1■■□□□ 1.93
ODC1-202ENST00000405333 MSH6P52701 1360 aa27.09■■□□□ 1.93
ODC1-202ENST00000405333 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
ODC1-202ENST00000405333 DCCP43146 1447 aa27.09■■□□□ 1.93
ODC1-202ENST00000405333 PIK3C2AO00443 1686 aa27.06■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 FOXO3O43524 673 aa27.06■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 COG3Q96JB2 828 aa27.06■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.04■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.04■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.04■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.03■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.02■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 PSME1Q06323 249 aa27.02■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.02■■□□□ 1.92
ODC1-202ENST00000405333 SHPRHQ149N8 1683 aa27.01■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 POLKQ9UBT6 870 aa27■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 KIF1AQ12756 1690 aa26.99■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.98■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 SOX12O15370 315 aa26.98■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 ABTB2Q8N961 1025 aa26.97■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 NLRP6P59044 892 aa26.96■■□□□ 1.91
ODC1-202ENST00000405333 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.95■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.94■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 USP31Q70CQ4 1352 aa26.94■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 CFAP53Q96M91 514 aa26.93■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.92■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 SLAIN2Q9P270 581 aa26.92■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 BRINP3Q76B58 766 aa26.9■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.9■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 USP54Q70EL1 1684 aa26.9■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.89■■□□□ 1.9
ODC1-202ENST00000405333 PEAK1Q9H792 1746 aa26.88■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 PLEKHG5O94827 1062 aa26.87■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.86■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.86■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 INSRP06213 1382 aa26.84■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.83■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 ALS2Q96Q42 1657 aa26.83■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 PXDNQ92626 1479 aa26.83■■□□□ 1.89
ODC1-202ENST00000405333 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.83■■□□□ 1.88
ODC1-202ENST00000405333 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ODC1-202ENST00000405333 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
ODC1-202ENST00000405333 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
ODC1-202ENST00000405333 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.79■■□□□ 1.88
ODC1-202ENST00000405333 NFAT5O94916 1531 aa26.78■■□□□ 1.88
ODC1-202ENST00000405333 IL13P35225 146 aa26.77■■□□□ 1.88
ODC1-202ENST00000405333 LTN1O94822 1766 aa26.77■■□□□ 1.88
ODC1-202ENST00000405333 NUDCQ9Y266 331 aa26.77■■□□□ 1.88
ODC1-202ENST00000405333 APAF1O14727 1248 aa26.76■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 SBNO1A3KN83 1393 aa26.75■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.74■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 SLIT3O75094 1523 aa26.74■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 USP19O94966 1318 aa26.73■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 GCP02774 474 aa26.73■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 AMPHP49418 695 aa26.73■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.72■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 FLT4P35916 1363 aa26.72■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.71■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.71■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 HMOX1P09601 288 aa26.71■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.71■■□□□ 1.87
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.7■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 RUNDC1Q96C34 613 aa26.7■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 HOXC9P31274 260 aa26.69■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.69■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.69■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.68■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms